El objetivo del presente estudio fue identificar la resistencia antibiótica de cepas aisladas de Salmonella enterica a partir de 384 muestras de canales de cuyes de un mercado de abasto en Lima, Perú. Las muestras fueron inoculadas en caldo de enriquecimiento y sembradas en medios de cultivo específicos. La identificación bacteriana se realizó a partir de pruebas bioquímicas y la resistencia antibiótica mediante el método de difusión en placa frente a 16 antibióticos. Se encontró el 28.9 ± 4.5% (111/384) de muestras positivas a cepas de Salmonella enterica. El 84.7% (94/111) mostró resistencia al menos a uno de los 16 antibióticos, mientras que 15.3% (17/111) fue sensible a todos los antibióticos. Asimismo, 40.5% (45/111) de las cepas mostró multidrogo resistencia (MDR) a tres o más antibióticos. Los resultados confirman el riesgo que representa para la salud pública la comercialización de canales de cuy contaminadas con cepas de Salmonella enterica resistentes a antibióticos.