2) ZEAINVENT TRNAVA s.r.o.; ŠM Farský Mlyn 2/6913 Trnava 917 01 Slovakia Abstract Maintaining genetic diversity for crop improvement and improving the quality of genetic resource management is both an inevitable part of nowadays maize breeding. ISSR markers brings the potential of finding a marker system to discriminate Iowa Stiff Stalk Synthetic and Iodent Reid populations of Zea mays, L. and on the base on coefficients of genetic distance and UPGMA grouping appropriate maize genotypes for the best potential for hybridization can be selected. The work presents the potential of ISSR markers in analysis of length polymorphism when a specific ISSR pattern can be used for fast screening of differences among maize genotypes and based of these differences lines can be used in breeding programms in a very specific mode. Key words:breeding, ISSR, Idt population, maize, SSS population Abstrakt Zachovanie genetickej rozmanitosti v šľachtení rastlín a zvyšovanie kvality genetických zdrojov sú nevyhnutnou súčasťou aj súčasného šľachtenia kukurice. ISSR markéry umoţňujú realizovať takúto poţiadavku ako markérovací systém schopný generovať odlišné dĺţkové profily pre Iowa Stiff Stalk Synthetic a Iodent Reid populácie kukurice a na základe koeficientov genetickej vzdialenosti a UPGMA zoskupení vybrať genotypy kukurice poskytujúce najlepší potenciál vo vzájomnom kríţení. V práci je prezentovaná vyuţiteľnosť ISSR markérov pri rýchlom skríningu odlišností jednotlivých línií kukurice a zapojiteľnosť takýchto výsledkov do praktických otázok šľachtenia. 1227 Detailed abstract V práci je analyzovaný potenciál náhodne sa naväzujúcich mikrosatelitných markérov odlíšiť ISS profil línií kukurice siatej patriacich k Iowa Stif Stalk Synthetic a Iodent Reid líniám. Biologický materiál vstupujúci do analýz bol tvorený desiatimi líniami tak, aby boli zastúpené línie s potvrdeným typom, línie v procese šľachtenia a spolu s nimi línia s otáznym typom, ktorú bolo cieľom na základe molekulárnych analýz priradiť vo vetvovom členení k jednej zo skupín. Línia s otáznym genotypom, o ktorej sa predpokladalo, ţe je Idt x SSS poskytovala v rozpore s predpokladom jej pôvodu veľmi dobrý heterózny efekt s SSS líniami. Biologický materiál bol získaný zo Zeainvent Trnava s.r.o., SR. Predpokladaný pôvod, resp. príslušnosť línii do skupín, bol odhadnutý na základe mnohoročných pozorovaní pri výbere šľachtiteľského materiálu, vychádzajúc predovšetkým z rodokmeňov línií. Celková genomická DNA bola izolovaná z čerstvých, zelených listov podľa Protokolu Rogers a Bendich. Analýzy ISSR markérmi boli uskutočnené s celkovo desiatimi prajmermi, z ktorých dva, (CA) 6 GT a GT(CA) 4 , boli vyhodnotené ako markéry s potenciálom odlíšiť SSS a Idt línie a priradiť spornú líniu k jednej zo skupín. Molekulárne analýzy prebehli v dvoch samostatných cykloch. V prvom boli uskutočnené testy schopnosti markérov odlišovať SSS a Idt línie a ich vzájomné zoskupenie vo vetvovom členení na základe Jaccardovho koeficientu genetickej príbuznosti. V týchto analýzach boli zaradené iba ...