RESUMO:Os cupins são insetos eusociais que habitam territórios com extremas associações de microrganismos, é considerado como praga por ocasionar grandes danos a áreas urbanas. Os métodos de forrageio e o habitat favorecem relações simbiônticas com bactérias e fungos, expondo sistemas capazes de processar enzimas e conceder mecanismos antimicrobianos de defesa em seu nicho ecológico. O objetivo desta pesquisa foi isolar, purificar, identificar e conservar os microrganismos associados aos cupins de Nasutitermes corniger e avaliar a interação in vitro destes microrganismos frente a bactérias patogênicas. Os cupins foram coletados na fazenda experimental da Universidade Federal do Amazonas situada na Rodovia BR-174 (Manaus-Presidente Figueiredo), Km 38. De forma estéril os cupins foram transportados ao laboratório de microbiologia da UFAM, ICB-01, Manaus-AM. Após assepsia, os cupins foram depositados um a um sob o meio de cultura BDA e colocados em seguida em câmaras climatizadas à temperatura de 28 ºC no escuro, por um período de sete dias. Os resultados obtidos na micromorfologia indicaram a presença de: Aspergillus sp., Penicillium sp., Absidia sp., Rhizopus sp., Mucor sp., e Curvullaria sp., como os microrganismos associados aos cupins. Os isolados foram submetidos a teste de antagonismo em confronto direto com cepas reativadas de microrganismos patogênicos, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Pseudomonas sp., e o fungo Cândida albicans, e os resultados avaliados de acordo com as analises estatísticas (ANOVA), onde foram observados resultados diferenciados nos tratamentos para cada teste, constatando-se que, para alguns fungos foi vantajoso e proporcionaram aumentos significativos no crescimento e desenvolvimento sobre as bactérias patogênicas. Os fungos Aspergillus sp., e Penicillium sp., além crescimento, liberou metabolitos secundários em cima e ao redor das bactérias Escherichia coli, Staphylococcus aureus e levedura Cândida albicans. O isolado Mucor sp. destacou-se por inibir todas as cepas reativadas na pesquisa, inclusive Pseudomonas sp., que demonstrou resistência a todos os outros isolados submetidos a atividade antagonista in vitro. Recomendamos a continuação dos estudos, pois outros microrganismos podem ser associados a estes cupins, incluindo aqueles de importância biotecnológica.