Standard approaches for dCas9-based modification of gene expression are limited in the ability to multiplex targets, establish streamlined cassettes, and utilize commonly studied Pol II promoters. In this work, we repurpose the dCas9-VPR activator to act as a dual-mode activator/repressor that can be programmed solely on the basis of target position at gene loci. Furthermore, we implement this approach using a streamlined Pol II-ribozyme system that allows expression of many sgRNAs from a single transcript. By "stepping" dCas9-VPR within the promoter region and ORF we create graded activation and repression (respectively) of target genes, allowing precise control over multiplexed gene modulation. Expression from the Pol II system increased the net amount of sgRNA production in cells by 3.88-fold relative to the Pol III SNR52 promoter, leading to a significant improvement in dCas9-VPR repression strength. Finally, we utilize our Pol II system to create galactose-inducible switching of gene expression states and multiplex constructs capable of modulating up to 4 native genes from a single vector. Our approach represents a significant step toward minimizing DNA required to assemble CRISPR systems in eukaryotes while enhancing the efficacy (greater repression strength), scale (more sgRNAs), and scope (inducibility) of dCas9-mediated gene regulation.
La Ingeniería Agrícola es la rama de la ingeniería orientada a dar respuesta a los problemas que plantea la agricultura moderna, mediante la aplicación de principios de las ciencias naturales y las matemáticas, procurando la conservación y el aumento del potencial del suelo, la producción de alimentos de calidad, el mantenimiento del medio ambiente y la dignificación del hombre rural. El objetivo de la ingeniería agrícola es la generación y aplicación de conocimientos científicos y tecnológicos de la ingeniería a la producción agropecuaria y otros biosistemas orientados a las áreas de adecuación de tierras, maquinaria agrícola, manejo de recursos hídricos, construcciones rurales, manejo poscosecha y procesamiento de producto agropecuarios, con criterios de sostenibilidad y competitividad.
El 80% de la producción mundial de yuca es utilizada para el consumo humano, aportando cerca del 10% de las calorías requeridas por el hombre además de ser el producto alimenticio carbohidratado, básico de 300 millones de personas en los países tropicales. La yuca, por sus características de cosecha y elevada humedad está sujeta a la rápida deterioración, exigiendo técnicas adecuadas para su conservación y/o procesamiento. Una de las maneras para evaluar las pérdidas de la yuca durante el proceso de secado, es cuantificar la deterioración de barras rectangulares o rodajas de yuca, utilizando como criterio el cambio de la coloración de su pigmento externo, por ser un factor de calidad que determina simplemente el grado de aceptabilidad del producto.
Abstract-This paper analyzes the universal software radio peripherical (USRP) B210 limitations and characteristics to develop applications on Software Defined Radar (SDRadar). The developed algorithm uses a frequency modulated constant wave (FMCW) which implement a chirp signal, taking considering that 25 MHz is the maximum bandwidth that the USRP can provide with a maximum resolution of 6 meters. The method improves the resolution through several signals transmitted with different bandwidths obtaining different resolutions, which were stored in a simple matrix and analyzed. After simulations, it is determined that the 14 measurements done with bandwidth spacing of 0.5 MHz between every signal is the best way to improve the resolution. Finally, two scenarios are described for the optimization procedure, the first scenario is limited with a measurement error less than 1 meter and the second scenario is limited by measurement error between 1 and 2 meters getting a better effectiveness of the measurement under the first scenario with 69.15% of detected objectives compared with the 30.85% of effectiveness of the second one. This paper demonstrates that the algorithm used is useful on SDRadar applications to detect objectives, for topographic applications or SAR systems. Index Terms-USRP B210, algorithm, SDRadar, FMCW, resolutionResumen-En este documento se analizan las limitaciones y características que tiene la tarjeta USRP (Universal Software Radio Peripheral) B210 para desarrollar aplicaciones de radar definidos por software (SDRadar). Para el desarrollo del algoritmo se utilizó un radar de onda continua modulada en frecuencia (FMCW) que implementa una señal chirp, al considerar que 25 MHz es el máximo ancho de banda que la tarjeta puede proporcionar se obtiene como resultado una resolución de 6 metros. El método utilizado para optimizar la resolución de la tarjeta fue transmitir un determinado número de señales con distintos anchos de banda, lo que resulta en una resolución diferente, al detectar y almacenar el objetivo en una matriz. Después de las pruebas correspondientes el algoritmo estableció que con 14 mediciones con variaciones de ancho de banda de 0.5 MHz, entre cada señal, se obtiene la mayor optimización para mejorar la resolución de la tarjeta. Se obtuvo finalmente dos zonas de optimización, donde la primera zona está limitada por un error de medición menor a 1 metro, y en la segunda zona con un error de medición entre 1 y 2 metros con 69.15% y 30.85% de objetivos detectados respectivamente, lo que determina su efectividad y confiabilidad. Este trabajo ha demostrado que el algoritmo utilizado es útil en aplicaciones SDRadar para detectar objetivos para aplicaciones topográficas o sistemas SAR. Uno de los inconvenientes de la tecnología SDR, es el ancho de banda que proporcionan para ser aplicados en sistemas SDRadar, que es una característica importante que depende de la capacidad de detección de dos objetivos o blancos en el rango, lo que es mejor conocida como resolución. Palabras Claves-USRPDesarro...
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