The taxonomic identification of Lonchothrix emiliae (Rodentia, Echimyidae, Eumysopinae) is problematic because of the overlap of morphological characters with its sister clade represented by species in the genus Mesomys which, like L . emiliae , is distributed throughout the Amazonian biome. Cytogenetic studies reported the karyotype of L . emiliae as 2n = 60/FN = 116, but this karyotype and samples were later designated as M . hispidus . To evaluate the karyotype diversity of Lonchothrix and Mesomys , and to provide data useful as karyological diagnostic characters, in the present study we made a comparative analysis of specimens of L . emiliae and M . stimulax collected from two Brazilian Amazonian localities, using C-banding, G-banding, FISH using rDNA 45S and telomeric probes, and Cytochrome-b (Cytb) sequences. The results indicate that L . emiliae has 2n = 64♀, 65♂/FN = 124 and a multiple sexual system (XX/XY 1 Y 2 ), while M . stimulax has 2n = 60/FN = 116. The Neo-X system found in L . emiliae also occurs in two Proechimys species, but cytogenetic analysis indicated an independent origin for these systems. The rDNA 45S analysis showed interstitial signals at one autosomal pair for each species, while an ITS found in L . emiliae was not coincident with the NOR. The molecular analysis confirmed Lonchothrix and Mesomys are sister genera, and the high level of intraspecific genetic divergence (7.1%) in M . stimulax suggests that it may be a species complex.

A família Echimyidae é conhecida como o grupo mais diversos dos roedores Hystricognathi sul-americanos. Variam de pequeno a médio porte e possuem diversificados hábitos de vida. O gênero Lonchothrix é monotípico (L. emiliae) e possui distribuição do baixo rio Madeira ao baixo rio Xingu e apenas ao sul do rio Amazonas. A identificação taxonômica de L. emiliae é confusa, devido a similaridades morfológicas com seu gênero irmão, Mesomys. Neste sentido, o único cariótipo previamente descrito para L. emiliae foi posteriormente associado à Mesomys hispidus (2n=60/NF=116). A partir de quatro amostras (uma fêmea e três machos) provenientes dos municípios de Juruti-PA e Parintis-AM, foram realizados bandeamentos cromossômicos G, C e FISH com sondas de rDNA 45S e telomérica em L. emiliae. A análise citogenética em L. emiliae mostrou cariótipo com 2n=64?/65? e NF=124, apresentando sistema sexual do tipo múltiplo. Os bandeamentos G e C possibilitaram a identificação dos homólogos e a classificação morfológica dos cromossomos, sendo todos os autossomos meta/submetacêntricos. O sexual X é submetacêntrico médio e os Y1 e Y2 são acrocêntricos pequenos. A heterocromatina constitutiva está distribuída na região centromérica de todos os autossomos e nos sexuais X e Y2; o sexual Y1 apresentou-se praticamente todo heterocromático. A FISH com sonda de rDNA 45S apresentou marcação na região intersticial do sexual X, com dois sinais na fêmea e um no macho. FISH com sonda telomérica apresentou marcação na região distal de todos os cromossomos; o par 4, adicionalmente, apresentou marcação na região pericentromérica. A ITS encontrada no par 4 pode ser um resquício de um rearranjo cromossômico do tipo fusão (comuns entre os Echimyidae), ou amplificação de sequências similares às teloméricas presentes na heterocromatina constitutiva, como sugerido para o gênero Proechimys (Echimyidae). O sistema sexual do tipo múltiplo (XX/XY1Y2) é devido a uma translocação autossomo/sexual. Assim, o presente trabalho apresenta os primeiros dados cariotípicos para L. emiliae, bem como descreve o sistema sexual do tipo múltiplo para esta espécie.