O ensino de ciências, como um processo de enculturação e construção do conhecimento, possibilita momentos de questionamentos e descobertas nos quais ocorre a identificação das necessidades do aluno e a ampliação do seu desenvolvimento cognitivo. As questões revestem-se de um importante papel na procura incessante do conhecimento, uma vez que levam à ponderação e à tentativa de encontrar respostas para resolver um problema. O ato de formular questões e de questionar, evidencia uma intenção ou um desejo de desvendar algo sobre um dado assunto e confere-se como um meio de partilha do conhecimento humano. Do reconhecimento de que a grande generalidade dos alunos adota uma postura passiva, fazendo poucas questões, e da admissão de que questionar é importante na aprendizagem dos mesmos, decorre a relevância de desenvolver um projeto de investigação científica, no âmbito da microbiologia, como forma de promover e estimular o questionamento dos alunos em Ciências Naturais, no oitavo ano, do terceiro ciclo do Ensino Básico, conduzindo a uma promoção das suas aprendizagens. No projeto PhytoFix, investiga-se o cultivo de plantas de arroz e suas bactérias endofíticas na presença de poluentes.