In running water, the main natural factor of disturbance is hydraulic. Investigation of its biological impact is currently complicated by the increase of anthropogenic disturbances which tend to mask the natural functioning of rivers. Monitoring of the impacts of the artificial alterations undergone by the Middle Rhône River for some decades took place in the mid-1980s. Discharge and temperature could constitute the major events controlling the biological dynamics in terms of variations in species richness, diversity, and abundance. The between-years changes of the structure and diversity of macroinvertebrate communities were connected with the amplitude of discharge fluctuations. This was in accordance with the disturbance-diversity concept and it seems to confirm the intermediate disturbance hypothesis. The fish community mainly depended on hydroclimatic factors that influenced breeding success. Variations in nutrient input played a secondary role in controlling changes in some communities (particularly the periphyton). Therefore it appears that the study of long-term changes in river systems, including the dynamics of their biological communities, requires continuous observations and data collection that only medium-to longterm studies can provide, implying the setting up of ecological monitoring centres for the natural environment such as the Long Term Ecological Research (LTER) sites in United States. En eau courante, le principal facteur naturel de perturbation est d'ordre hydraulique. A l'heure actuelle, ce problème se trouve particulièrement compliqué par l'accroissement des perturbations anthropiques qui tendent à masquer le fonctionnement naturel des cours d'eau. Un suivi des impacts des perturbations anthropiques subies depuis plusieurs décennies par le Rhône Moyen a été mis en place au milieu des années 80. L'hydrologie et la température semblent les principaux événements régissant la dynamique biologique en terme de variation de la richesse spécifique, de la diversité et de l'abondance des différentes espèces. Les variations inter-annuelles de la structure et de la diversité des peuplements de macoinvertébrés sont ainsi liées à l'amplitude des fluctuations de débit. Ceci est tout à fait en accord avec le concept de perturbation-diversité et la théorie des perturbations moyennes. Pour sa part, le peuplement piscicole dépend des facteurs hydroclimatiques pour le succès de la reproduction. En second lieu, la dynamique des. apports nutritifs gouverne également l'évolution de certains peuplements (en particulier le periphyton). Dans ce cadre, l'étude de l'évolution des hydrosystèmes fluviaux et de la dynamique de leurs peuplements impliquent une continuité d'observation et de récolte de données que seule permet une surveillance à moyen ou long terme, nécessitant la mise en place de véritables observatoires écologiques du milieu naturel, tels que les sites du programme LTER (Long Term Ecological Research) aux Etats-Unis.

Résumé. -Le bilan des dix premières années de suivi de l'influence du rejet d'eau de refroidissement de la centrale nucléaire de Saint-Alban, implantée sur le Rhône environ 50 km à l'aval de Lyon, a permis d'établir que les caractéristiques physiques, chimiques et biologiques du Rhône-Moyen sont issues, en premier lieu, de l'anthropisation du fleuve et de sa vallée. D'un point de vue biologique, le système a dérivé vers un type potamique lent, composé d'espèces ubiquistes et résistantes et de quelques espèces lotiques plus sensibles mais relictuelles. D'un point de vue physico-chimique, ses grandes dimensions et l'inertie que cela confère à la masse d'eau vis-à-vis des apports extérieurs permettent au milieu d'assimiler des charges minérale et organique importantes. Linfluence du rejet d'eau échauffée se manifeste par une augmentation de la température de l'eau à l'aval du site, voire dans la partie court-circuitée. Les effets sur la faune et la flore sont toutefois modérés, ou non significatifs, probablement masqués par les modifications antérieures à l'implantation de la centrale, dues à l'anthropisation contemporaine du milieu (régulation et canalisation, rejets domestiques et industriels divers). Lhydrologie et la température apparaissent comme les événements majeurs régissant la dynamique physico-chimique et biologique du secteur (variations inter-annuelles des paramètres physico-chimiques, de la richesse, de la diversité et de l'abondance des différentes espèces végétales et animales Résumé. -Le bilan des dix premières années de suivi de l'influence du rejet d'eau de refroidissement de la centrale nucléaire de Saint-Alban, implantée sur le Rhône environ 50 km à l'aval de Lyon, a permis d'établir que les caractéristiques physiques, chimiques et biologiques du Rhône-Moyen sont issues, en premier lieu, de l'anthropisation du fleuve et de sa vallée. D'un point de vue biologique, le système a dérivé vers un type potamique lent, composé d'espèces ubiquistes et résistantes et de quelques espèces lotiques plus sensibles mais relictuelles. D'un point de vue physico-chimique, ses grandes dimensions et l'inertie que cela confère à la masse d'eau vis-à-vis des apports extérieurs permettent au milieu d'assimiler des charges minérale et organique importantes. Linfluence du rejet d'eau échauffée se manifeste par une augmentation de la température de l'eau à l'aval du site, voire dans la partie court-circuitée. Les effets sur la faune et la flore sont toutefois modérés, ou non significatifs, probablement masqués par les modifications antérieures à l'implantation de la centrale, dues à l'anthropisation contemporaine du milieu (régulation et canalisation, rejets domestiques et industriels divers). Lhydrologie et la température apparaissent comme les événements majeurs régissant la dynamique physico-chimique et biologique du secteur (variations inter-annuelles des paramètres physico-chimiques, de la richesse, de la diversité et de l'abondance des différentes espèces végétales et animales). La saisonnalité des facteurs thermi...

/ The part of the Doubs River between Montbeliard and Dole (France), i.e., downstream from the confluence with the Allan River, will be affected by the Rhine- Rhone connection project. In order to improve the understanding of the Doubs ichthyofauna, aquatic environments of the Doubs were sampled by electrofishing. Fish diversity and the presence of some rheophilic species demonstrated the good ecological quality of some stretches of the Doubs. This quality was due to alternating areas with very diversified aquatic environments (riffles, islands and side-arms, backwaters) and a considerable range of flow velocities. The differences in the structure of the fish communities of the different types of aquatic environments were more qualitative (fish species) than quantitative (number of species and number of fish). However, the mean number of fish was statistically lower in the canals (Freycinet canal and channelized part of the Allan River) than in the main course and in the backwaters. The natural parts of the Doubs (unnavigable reaches) showed the most diversified environmental structure and had the most rheophilic fish communities. Thus, the rheophilic species were well represented, but they proved also the most vulnerable to river regulation. However, the most abundant fishes throughout the Doubs River were generalists with no special requirements for food sources or spawning substrate.KEY WORDS: Fish communities; Regulation; Restoration; Floodplain; Large ship canal; Doubs River