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Resumo As frequências alélicas de seis marcadores autossómicos do tipo short tandem repeat (STR) (TH01, TPOX, CSF1PO, D13S317, D7S820 e D16S539) foram estimadas numa amostra populacional (N=53-85) de São Tomé e Príncipe (África Ocidental). Não foram encontrados desvios significativos ao equilíbrio de HardyWeinberg em qualquer dos loci. A distribuição de frequências e valores de heterozigotia são semelhantes aos encontrados noutras populações Africanas sub-Saarianas.Palavras-chave São Tomé e Príncipe; short tandem repeats (STRs); genética populacional.Abstract Allele frequencies of six autosomal short tandem repeat (STR) markers (TH01, TPOX, CSF1PO, D13S317, D7S820 and D16S539) were estimated in a population sample (N=53-85) of unrelated individuals from São Tomé e Principe (West Africa). No deviations from Hardy-Weinberg equilibrium were observed for all loci. Allele frequency distribution and heterozygosity values were similar with those from other sub-Saharan African populations.