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Seed from 126 trees from populations representing 15 geographic locations covering much of the natural range of shortleaf pine (Pinus echinata Mill.) were analyzed using 23 enzyme systems covering 39 loci to determine patterns of genetic variation and structure. Populations were polymorphic (p) at 87.2% of the loci, had 2.18 alleles (A) per locus, and had 2.35 alleles per polymorphic locus (A p ). Mean expected heterozygosity (H e ) was 0.194 and mean observed heterozygosity (H o ) was 0.174. Western populations had a higher p, higher A, similar A p , and a higher H o and H e than eastern populations, in part because of six private alleles (alleles seen only in one population) in the west but only one in the east. Genetic structure analysis revealed interpopulation genetic variation at 9%, meaning 91% of the genetic variation in shortleaf pine resides within populations. Interpopulation gene flow was 2.56, indicating two or three allele migrations per generation, which is relatively high and explains the low interpopulation genetic variation in the species. There was no apparent relationship between geographic distance among populations and their genetic distance. Shortleaf pine populations exist in naturally outcrossing random-mating populations and have a relatively large amount of natural variability. Western populations are more diverse than their eastern counterparts.Résumé : Les auteurs ont déterminé les patrons de la variabilité génétique et sa structure chez le pin jaune (Pinus echinata Mill.) à partir de graines récoltées sur 126 arbres représentatifs de 15 localités géographiquement distinctes couvrant la plus grande partie de l'aire de distribution naturelle. Pour ce faire, la variation d'isoenzymes fut évaluée pour 23 systèmes enzymatiques représentatifs de 39 loci. En moyenne, les populations étaient polymorphes (p) pour 87,2% des loci. Elles affichaient 2,18 allèles par locus (A) et 2,35 allèles par locus polymorph (A p ). L'hétérozygotie moyenne espérée (H e ) atteignait une valeur de 0,194 alors que l'hétérozygotie moyenne observée (H o ) était de 0,174. Les populations de l'ouest affichaient des valeurs plus élevées que les populations de l'est pour les paramètres p, A, H o et H e , alors que le paramètre A p était similaire pour les deux groupes de populations. Ces résultats sont en partie attribuables à la présence de six allèles privées (présentes dans une seule population) dans l'ouest comparativement à une seule dans l'est. L'analyse de la structure génétique a révélé que 9% de la variabilité génétique était attribuable à la différenciation de populations, indiquant que 91% de la variabilité génétique se retrouvait au sein des populations chez le pin jaune. Le flux génique inter-population a été estimé à 2,56, indiquant ainsi qu'il y avait deux ou trois migrations d'allèles par génération. Cet estimé est relativement élevé et il explique la faible différenciation de populations observée chez cette espèce. Les auteurs n'ont pas observé de relation significative entre les distances géographiqu...