, Institute of Fisheries NAAS, Кyiv Purpose. Study of the peculiarities of the genetic structure based on genetic-biochemical markers in age-1+ and 2+ rainbow trout of the fish farm "Sloboda Banilov", Chernivtsi region Methodology. We used the methods of vertical polyacrylamide and horizontal starch electrophoresis with own modification. Sampling of biological material and histochemical and staining of gel plates were performed according to generally accepted methods. The frequency of allele and genotypic variants were calculated, actual and expected level of heterozygosis for each individual locus and the level of mean heterozygosis per locus were determined, Wright F fixation index was calculated. Statistical processing of experimental data was performed with the use "Biosys-1" software. Findings. We performed an analysis of the genetic structure of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) groups with the use of genetic-biochemical markers-esterase loci (
, Інститут рибного господарства НААН, м. Київ Мета. Вивчення специфіки генетичної структури, рівня внутрішньо-та міжпопуляційної генетичної мінливості стад українського лускатого коропа різних господарств України за використання ДНК-маркерів (ISSR-PCR). Методика. Для дослідження специфіки генетичної структури на підставі ПЛР використовували ІSSR-PCR-методику з відповідно підібраними праймерами. Результати. На підставі виконаних досліджень за використання трьох мікросателітних локусів ДНК-(AGC) 6 G, (AСC) 6 G, (AGC) 6 С-проведено аналіз генетичної структури українських лускатих коропів. Сумарно за всіма праймерами виявлено 55 ампліконів. При використанні праймеру (AGC) 6 G виявлено 15, (AСC) 6 G-17, (AGC) 6 С-23 амплікони. Молекулярна маса на електрофореграмах була максимальною при використанні праймеру (AСC) 6 G (500 п.н.-3500 п.н. у нивківського коропа). Виявлені специфічні особливості між досліджуваними популяціями лускатих коропів залежать від їх генетичного походження. Варіацій виявлених ампліконів достатньо, щоб відокремлювати особин, або, якщо робота проводиться з групою плідників, підбирати батьківські пари для підвищення генетичного розмаїття. Наукова новизна. За використання ISSR-маркерів встановлено особливості генетичної структури, рівень генетичної мінливості українських лускатих коропів. Вперше отримано нові дані про специфіку генетичної структури за використання методів ПЛР, які сприяють виявленню специфіки механізмів підтримки відносної стабільності генофонду українського лускатого коропа і дозволяють контролювати та зберігати специфічність його генетичної структури. Практична значимість. Запропоновано метод генетичного контролю стад, який дає можливість за використання вказаних праймерів провести аналіз генетичної структури племінних стад і реалізувати генетичну інформацію на різних стадіях селекційного процесу.
The rational use of valuable fish species from aquaculture is difficult to implement without knowledge of the state of the genetic structure of local stocks. Different types of DNA markers can be used to achieve the goals of selection and breeding work. The genetic structure of a local stock of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) (Salmoniformes, Salmonidae) farmed in Ukraine was studied using DNA-markers: microsatellite (SSR-markers – simple-sequence repeats-markers) and intermicrosatellite (ISSR – inter-simple sequence repeat). Five fragments of trinucleotide microsatellite motifs with a single anchor nucleotide at the 3'-end were used as a primer for analysis by the ISSR-PCR method. Totally, 85 amplicons were obtained across the five loci, of which 92.9% were polymorphic. The total number of alleles ranged from 10 (marker (ACC)₆G) to 23 (marker (AGC)₆G). The following monomorphic amplicons were determined for the studied local stock of rainbow trout: according to marker (CTC)₆C – 770 and 520 bp bands, for the marker (GAG)₆C – 345, 295 and 260 bp, and for the marker (AGC)₆C – 350 bp. The average number of polymorphic bands per locus was 15.8. The selected ISSR primers had a level of polymorphic information content above the average. The most effective markers for molecular-genetic analysis of rainbow trout were (AGC)₆G and (AGC)₆C according to the percentage of polymorphic bands, marker index, effective multiplex ratio and resolving power. The selected ISSR loci allow the genetic structure of the studied local stock to be characterized using the total and the effective number of alleles per locus (Na and Ne were 1.9 and 1.4, respectively), the Shannon index (average value I was 0.4) and the unbiased expected heterozygosity (mean uHe = 0.3). Microsatellite-based analysis showed features of the genetic structure of the local stock of rainbow trout at six microsatellite loci (OMM 1032, OMM 1077, OMM 1088, Str 15, Str 60, Str 73). Allelic diversity was established and alleles with the highest frequency and most typical for the given stock were identified. The Shannon index and unbiased expected heterozygosity were determined using SSR-markers and were 1.42 and 0.79, respectively. This depicts the complexity of the population structure, a high level of genetic diversity and indicates a high level of heterozygosity of local stock. The “gene pool profile” established as a result of ISSR-PCR in the future will help to differentiate local stocks of rainbow trout in aquaculture of Ukraine. Microsatellite markers provide the ability to determine individual features of genetic variation of local populations and to conduct the management of genetic resources on fish farms.
, Інститут рибного господарства НААН, м. Київ Мета. Дослідити генетичну структуру племінного стада стерляді, сформованого в умовах плавучих садків рибного господарства індустріального типу. Методика. Штучне відтворення та вирощування стерляді здійснювали із застосуванням індустріальних технологій рибництва. Аналіз поліморфізму білкових речовин проводили з використанням методів електрофорезу в поліакриламідному гелі. У якості молекулярно-генетичних маркерів для оцінки генетичної структури групи риб чотиришестилітнього віку (n = 30) розглядали розподіл алельних та генотипних частот за локусами, що кодують низку білків і ферментів крові тварин: трансферину (TF), посттрансферину (PTF), альбуміну (ALB). Статистичне опрацювання отриманих даних виконували із застосуванням традиційних прийомів. Результати. Установлено, що генетична структура групи племінних особин стерляді із масою тіла в межах 1,0-2,3 кг (в середньому 1,68 ± 0,07 кг, С v = 22,3%) характеризується значним рівнем гетерозиготності (66,7%). Із розглянутих генетико-біохімічних систем найбільш інформативними для виявлення міжгрупових відмінностей за генетичними структурами виявились системи TF та ALB. Отримані дані дають змогу припустити, що оцінка поліморфізму за локусами трансферину та альбуміну може сприяти об'єктивному контролю ступеня інбредності племінних груп стерляді за індустріальних методів ведення аквакультури. Наголошується на необхідності проведення комплексних генетичних досліджень у процесі формування племінних стад осетрових риб в індустріальному рибництві. Наукова новизна. Досліджено генетичну структуру стерляді за нетрадиційного для аквакультури України технологічного варіанту формування та експлуатації племінних стад осетрових риб. Практична значимість. Результати досліджень являють інтерес для контролю та поліпшення стану племінних ресурсів осетрових риб в аквакультурі України.
The genetic structure of rainbow trout farmed in Ukraine were characterized based on microsatellite loci. The selected set of SSR-markers (Simple-sequence repeatsmarkers) had a high degree of polymorphism that allowed determining the specificity of each local stock (average PIC value = 0.785 ± 0.034). The microsatellite analysis of rainbow trout from the studied stocks showed a high level of genetic diversity (uHe = 0.825 ± 0.030, PIC = 0.785 ± 0.034, I = 1.836 ± 0.127). The level of allelic diversity of the selected loci was high, where the average number of alleles per locus was 7.833, the effective number of alleles per locus was 5.687. The range of amplicon sizes of the studied loci and private alleles for each local group was determined. The cluster analysis showed the presence of three clusters. The range of genetic variability was presented in the graphical interpretation of the principal coordinates analysis (PCoA). Based on unbiased genetic distances, the Kharkiv and Transcarpathian local stocks were found to be the closest, while the Chernivtsi stock was the most distant from them.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
customersupport@researchsolutions.com
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.
Copyright © 2025 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.