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La infertilidad es un problema común que afecta a una de cada seis parejas. Puede ser definida como la incapacidad de completar un embarazo luego de un tiempo azonable de relaciones sexuales sin tomar medidas anticonceptivas. Las causas del incremento en la prevalencia de la infertilidad son difíciles de establecer. Este aumento podría deberse por lo menos a cuatro factores: postergación del momento en que se decide tener hijos, alteraciones en la calidad del semen debido a hábitos como el tabaquismo y el alcohol, cambios en la conducta sexual y eliminación de la mayoría de los tabúes.El estudio de la pareja infértil siempre se ha enfocado considerando diferentes factores: el ovulatorio (presente en alrededor de 20% de las parejas), el útero-tubárico-peritoneal (se observa en ~30% de las parejas), el de migración del semen (10% de los casos) y el masculino (30% de las parejas). Cerca de 40% de todas las parejas infértiles presentan una combinación de factores y aproximadamente el 15% no evidencia ninguna alteración objetiva que lleve a un diagnóstico definido. Durante las últimas dos décadas se registraron tres cambios importantes en el enfoque de la infertilidad. En primer lugar, la introducción de las tecnologías de reproducción asistida ha brindado una oportunidad de estudiar los procesos reproductivos básicos. En segundo lugar, han ocurrido cambios en la sociedad tales como un aumento en la proporción de mujeres mayores de 35 años que buscan el embarazo; este hecho obedece a que la gente se casa a edades más tardías y posterga el embarazo. En tercer lugar, el desarrollo de la biología molecular y de la genética se han hecho muy importantes para el estudio, diagnóstico y evaluación de las parejas, muchas de ellas consideradas hasta ahora como "parejas infértiles sin explicación".

Objective: To present the development of the first custom gene panel for the diagnosis of male and female infertility in Latin America.Methods: We developed a next-generation sequencing (NGS) panel that assesses genes associated with infertility. The panel targeted exons and their flanking regions. Selected introns in the CFTR gene were also included. The FMR1 gene and Y chromosome microdeletions were analyzed with other recommended methodologies. An inhouse developed bioinformatic pipeline was applied for the interpretation of the results. Clear infertility phenotypes, idiopathic infertility, and samples with known pathogenic variants were evaluated.Results: A total of 75 genes were selected based on female (primary ovarian insufficiency, risk of ovarian hyperstimulation syndrome, recurrent pregnancy loss, oocyte maturation defects, and embryo development arrest) and male conditions (azoospermia, severe oligospermia, asthenozoospermia, and teratozoospermia). The panel designed was used to assess 25 DNA samples. Two of the variants found were classified as pathogenic and enable the diagnosis of a woman with secondary amenorrhea and a man with oligoasthenoteratozoospermia. Targeted NGS assay metrics resulted in a mean of 180X coverage, with more than 98% of the bases covered ≥20X. Conclusion:Our custom gene sequencing panel designed for the diagnosis of male and female infertility caused by genetic defects revealed the underlying genetic cause of some cases of infertility. The panel will allow us to develop more precise approaches in assisted reproduction.

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