La sostenibilidad de agroindustrias convencionales se enfoca hacia la transición en biorrefinerías. El objetivo de este trabajo fue evaluar estrategias para obtener biocombustible sólido, abonos de los subproductos de las agroindustrias de naranja de jugo y caña de azúcar en Veracruz, México y la zonificación agroecológica para determinar la expansión de estos cultivos de manera sostenible para futuras biorrefinerías integrales. El método de biosecado empleó cáscaras de naranja, bagazo de caña y residuos de cosecha obteniendo un biocombustible sólido al reducir la humedad inicial de 87,72% a 12,28 % en un periodo de 30 días. Se evaluaron seis tratamientos de producción de abono en contenedores plásticos de 30 a 90 días utilizando subproductos: cáscara de naranja, cachaza, vinazas, melazas, cenizas, estiércoles, residuos de cosecha cañera y de producción de hongos comestibles mediante las técnicas de compostaje, vermicompostaje y bocashi. Se obtuvieron abonos con pH de 5,4 a 12, M.O. de 3 a 70 % y relación C/N de 8 a 40. La zonificación agroecológica se realizó con el software Maxent. Se determinó que las regiones geográficas con mayor aptitud para cultivos de cítricos y caña de azúcar se localizan en el sureste mexicano y en particular el estado de Veracruz. Para caña de azúcar, los factores limitantes a la productividad como materia prima para biorrefinerías, están relacionados con el acceso al agua (precipitación pluvial) y explican el 57,1 % de la simulación. En el caso de cítricos, los factores se relacionan con temperatura, precipitación pluvial y topografía, que en su conjunto impactan el 44,5 %.