Background. The ongoing pandemic of the novel coronavirus infection (COVID-19) draws attention to the significance of molecular and genetic monitoring of the SARS-CoV-2 spread among the population of the Russian Federation. The aim of the study was to analyze the dynamics of circulation of SARS-CoV-2 genetic variants in Russia.Materials and methods. The analysis of the circulation dynamics for SARS-CoV-2 genetic variants in Russia was carried out, covering the period from 28/12/2020 to 26/6/2022. The analysis included the data from Rospotrebnadzor Report No. 970 "Information about Infectious Diseases in Individuals with Suspected Novel Coronavirus Infection" and the Virus Genome Aggregator of Russia (VGARus). The presence of SARS-CoV-2 RNA was confirmed by the real-time reverse transcription polymerase chain reaction. The primer panels developed at the Central Research Institute of Epidemiology were used for amplification of genomic fragments and the subsequent sequencing.Results and discussion. Using the Russian VGARus platform developed by the Central Research Institute of Epidemiology, we received the data on mutational variability of SARS-CoV-2. By monitoring the circulation of SARS-CoV-2 genetic variants in Russia from 28/12/2020 to 26/6/2022, we found that Delta and Omicron genetic variants prevailed at different stages of the epidemic.Conclusion. The data of molecular and genetic studies are an essential component of epidemiological surveillance, being critically important for making executive decisions aimed at prevention of further spread of SARS-CoV-2 and laying the groundwork for creating new vaccines.

Представлены результаты исследования бактериальной микрофлоры двух групп пациентов, больных внебольничной пневмонией («Covid+», N=86 и «Covid–», N=87). Обе группы характеризуются высоким уровнем выделения бактериальной флоры (81,4% и 74,7%), в том числе общепринятых возбудителей внебольничных пневмоний, существенной частотой выделения грибов рода Candida и микробных ассоциаций. Группа больных «Covid+» характеризуется более широким спектром определяемых возбудителей, выявлением полирезистентных грамотрицательных энтеробактерий – продуцентов БЛРС, грамотрицательных неферментирующих полирезистентных бактерий, более выраженным проявлением микробных ассоциаций. В группе наблюдения «Covid-» лекарственноустойчивая флора представлена только стафилококками групп MRSA, MRSE и др.

Проведен анализ научных публикаций по вопросам основ патогенеза, лабораторной и рентгенологической картины пневмоний, а также вопросов ко-инфицирования у больных с SARS-CoV-2. На основе имеющихся в мировой научной литературе сведений дана оценка чувствительности методам компьютерной томографии и полимеразной цепной реакции. Наряду со сбором эпидемиологического анамнеза, обоснована необходимость применения как лабораторных, так и лучевых методов диагностики для наиболее достоверного выявления пациентов с новой коронавирусной пневмонией. Ключевые слова: SARS-CoV-2, пневмония, полимеразная цепная реакция, компьютерная томография, ко-инфекция

Background. The ongoing pandemic of a new coronavirus infection (COVID-19) determines the relevance of the analysis of epidemiological patterns of SARS-CoV-2 spread among the population of the Russian Federation.Aim — study of the manifestations of the epidemic process of COVID-19 in the Russian Federation in 2020–2022.Materials and methods. A retrospective epidemiological analysis of the incidence of COVID-19 in the Russian Federation was carried out from 03/30/2020 to 04/24/2022. The data from the Rospotrebnadzor report No. 970 “Information on cases of infectious diseases in persons with suspected new coronavirus infection”, information portal Stopcoronavirus.rf, etc. were used. The presence of SARS-CoV-2 RNA was confirmed by real-time RT-PCR.Results and discussion. The analysis of the manifestations of the epidemic process of COVID-19 in the Russian Federation in 2020–2022 showed the presence of two stages which differed depending on the influence of the biological factor and the ongoing anti-epidemic measures. There was a pronounced trend in the development of the epidemic process, starting from megacities (Moscow, Moscow region and St. Petersburg), which are major transport hubs and centers of migration activity of the population, to the regions of the Russian Federation. The SARS-CoV-2 pathogenicity has been shown to decrease with each subsequent cycle of the rise in the incidence of COVID-19 against the background of the increased contagiousness of the virus.Conclusion. As a result of the study, risk areas (megacities) and risk groups were identified.

Введение. Эпидемиологические особенности возникновения и распространения ВИЧ-инфекции в Дальневосточном федеральном округе (ДВФО) обусловлены во многом специфической демографической ситуацией и географическим положением. Постоянные изменения в численности населения округа находятся под воздействием двух основных факторов: естественной убыли и миграции как внутренней, так и международной. Количество иностранных граждан, въезжающих на административные территории округа по рабочим визам из стран ближнего и дальнего зарубежья, постоянно увеличивается. В ДВФО, как и в целом по Российской Федерации, продолжает увеличиваться число ВИЧинфицированных пациентов. Так, в 2015 году, по данным региональных Центров по профилактике и борьбе со СПИД, выявлен 2241 новый случай ВИЧ-инфекции, что на 487 случаев больше, чем в 2014 году. Показатель заболеваемости в целом по округу в 2015 году составил 36,08 на 100 тысяч населения. На 01.01.2016 г. кумулятивное количество инфицированных, выявленных в ДВФО, возросло до 20 977 человек, показатель пораженности населения ВИЧ-инфекцией составил 337,72 случая на 100 тысяч населения. Наиболее пораженными ВИЧ-инфекцией территориями являются Приморский и Хабаровский края, Магаданская область, Чукотский автономный округ (ЧАО). Наименее пораженной остается Еврейская автономная область (ЕАО). На 01.01.2016 г. на диспансерном учете состояло 11 422 ВИЧ-инфицированных пациента ДВФО, 45% из которых находились в субклинической (3) стадии ВИЧ-инфекции. В последние годы существенно увеличился охват лечением ВИЧ-