Characteristics of SARS-CoV-2 variants of concern B.1.1.7, B.1.351 or P.1: data from seven EU/EEA countries, weeks 38/2020 to 10/2021

Funk, Tjede; Pharris, Anastasia; Spiteri, Gianfranco; Bundle, Nick; Melidou, Angeliki; Carr, Michael J.; González, Gabriel; Garcia-Leon, Alejandro; Crispie, Fiona; O’Connor, Lois; Murphy, Niamh; Mossong, Joël; Vergison, Anne; Wienecke-Baldacchino, Anke; Abdelrahman, Tamer; Riccardo, Flavia; Stefanelli, Paola; Martino, Angela Di; Bella, Antonino; Presti, Alessandra Lo; Casaca, Pedro; Moreno, Joana; Borges, Vítor; Isidro, Joana; Ferreira, Rita; Gomes, João Paulo; Dotsenko, Liidia; Suija, Heleene; Epštein, Jevgenia; Sadikova, Olga; Sepp, Hanna; Ikonen, Niina; Savolainen-Kopra, Carita; Blomqvist, Soile; Möttönen, Teemu; Helve, Otto; Gomes-Dias, Joana; Adlhoch, Cornelia

doi:10.2807/1560-7917.es.2021.26.16.2100348

Cited by 248 publications

(207 citation statements)

References 7 publications

Supporting

Mentioning

166

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…10 This adds to the evidence of higher severity covid-19 after infection with B.1.1.7 compared with wild-type SARS-CoV-2, as further indicated by its association with higher risk of intensive care admission and death. 6 7 8 9 10 23 …”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

“…Our finding of lower age specific hazard ratio estimates in younger age groups are consistent with a previously reported age specific adjusted odds ratio of hospital admission of 1.0 for patients aged 0-19 with versus without SGTF variants in seven EU/EEA countries but contrasts with a study in Denmark that reported an adjusted odds ratio of 1.84 for patients aged 0-29 with SGTF variants. 23 24 Children and adolescents aged ≤18 who were admitted to hospital with covid-19 in November 2020 to January 2021 at King’s College Hospital in London (where the local prevalence of B.1.1.7 was high) were reported to have had similar clinical severity and treatment requirements to those admitted in March to May 2020, 25 corroborating the suggestion that patients in the youngest age groups experience no more severe disease if infected with B.1.1.7 than with wild-type SARS-CoV-2.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

“….6-1.7 based on data from Scotland,11 seven EU/EEA countries,23 Denmark,24 and Canada 10. This adds toon 20 June 2021 by guest.…”

mentioning

confidence: 97%

See 2 more Smart Citations

Risk of hospital admission for patients with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7: cohort analysis

Nyberg

Twohig

Harris

et al. 2021

BMJ

139

114

View full text Add to dashboard Cite

Objective To evaluate the relation between diagnosis of covid-19 with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7 (also known as variant of concern 202012/01) and the risk of hospital admission compared with diagnosis with wild-type SARS-CoV-2 variants. Design Retrospective cohort analysis. Setting Community based SARS-CoV-2 testing in England, individually linked with hospital admission data. Participants 839 278 patients with laboratory confirmed covid-19, of whom 36 233 had been admitted to hospital within 14 days, tested between 23 November 2020 and 31 January 2021 and analysed at a laboratory with an available TaqPath assay that enables assessment of S-gene target failure (SGTF), a proxy test for the B.1.1.7 variant. Patient data were stratified by age, sex, ethnicity, deprivation, region of residence, and date of positive test. Main outcome measures Hospital admission between one and 14 days after the first positive SARS-CoV-2 test. Results 27 710 (4.7%) of 592 409 patients with SGTF variants and 8523 (3.5%) of 246 869 patients without SGTF variants had been admitted to hospital within one to 14 days. The stratum adjusted hazard ratio of hospital admission was 1.52 (95% confidence interval 1.47 to 1.57) for patients with covid-19 infected with SGTF variants, compared with those infected with non-SGTF variants. The effect was modified by age (P<0.001), with hazard ratios of 0.93-1.21 in patients younger than 20 years with versus without SGTF variants, 1.29 in those aged 20-29, and 1.45-1.65 in those aged ≥30 years. The adjusted absolute risk of hospital admission within 14 days was 4.7% (95% confidence interval 4.6% to 4.7%) for patients with SGTF variants and 3.5% (3.4% to 3.5%) for those with non-SGTF variants. Conclusions The results suggest that the risk of hospital admission is higher for people infected with the B.1.1.7 variant compared with wild-type SARS-CoV-2, likely reflecting a more severe disease. The higher severity may be specific to adults older than 30 years.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

Risk of hospital admission for patients with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7: cohort analysis

Nyberg

Twohig

Harris

et al. 2021

BMJ

139

114

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…La variante inglesa es la más extendida, incluyendo la población más joven (19,4 % 0-19 años, 31,3 % 20-29 años, 32,0 % 40-59 años). Representa un riesgo triple de hospitalización para el grupo de edad de 20-39 años y 2,3 veces más para el grupo de edad de 40-59, doblando el riesgo de necesitar cuidados intensivos para el grupo de edad de 40-59 9 .…”

Section: Acceso Abiertounclassified

La larga y dolorosa curva de aprendizaje sobre COVID-19

Parigi

2021

Alerta

View full text Add to dashboard Cite

«¡Salud!» «¡Que el Señor te proteja!»; el deseo que generalmente expresamos cuando alguien estornuda, se empezó a usar hace siete siglos, en 1384. En ese año, un estornudo podría representar un acto fisiológico sin trascendencia o el primer síntoma de la peste negra, que podría haber matado a la víctima en tan solo unos días. Aún ahora, experimentamos los efectos posteriores de esa pandemia, en la misma forma que los efectos posteriores de la COVID-19 nos afectarán en años futuros, comenzando por la frustrante experiencia de tener que estudiar y experimentar cómo luchar contra un virus totalmente desconocido en una lenta y dolorosa curva de aprendizaje. Después de China, Italia fue el siguiente país afectado por el virus; tan solo en febrero de 2020, nuestro hospital de enseñanza identificó a una persona del sexo masculino con una frecuencia respiratoria mayor a 22, con cáncer como enfermedad comórbida, trombocitopenia y la proporción de presión arterial parcial de oxígeno/oxígeno inspirado fraccional menor a 260, siendo significativamente asociado a la posibilidad de una enfermedad severa 1. Se inició el estudio de terapias de apoyo, entre las cuales la más prometedora fue el uso de plasma hiperinmune, estudiado extensivamente en nuestro hospital con una eficacia probada2,. siempre que fuera usada en las etapas tempranas de la replicación viral, así como la dexametasona y los antígenos monoclonales, que resultaron totalmente ineficaces durante la subsecuente tormenta de citoquinas, presentes en los casos de mayor severidad. El panorama global ha cambiado radicalmente en tan solo un año. Por un lado, la aparición de las vacunas, por el otro las diversas variantes del virus, nos muestran que aún queda mucho por aprender en una curva de aprendizaje desalentadora que los 357 316 casos registrados en un día en India hacen particularmente doloroso3.En cuanto a lo relacionado con la producción de vacunas, la producción total en marzo fue de 413 millones de dosis, mientras que el pronóstico para finales del año es de contar con 9,5 billones de dosis disponibles4. Su uso ha resultado ser seguro aun para personas con severas alergias a comidas, medicamentos orales, uso de latex y picaduras de avispas5.Si bien, nuestro objetivo es vacunar a la mayor cantidad de personas posibles, todavía estamos en la curva de aprendizaje sobre la protección real de la vacuna. De acuerdo con ISARIC4C6, de los 99 445 pacientes hospitalizados por COVID-19, 3842 (7,3 %) han sido vacunados, de los cuales el 40 % desarrolló síntomas después de 0-7 días de haber sido vacunados y 19 % después de 8-14 días. Dado que el período promedio deincubación para el SARS-CoV-2 es aproximadamente de 5 días, es probable que estos pacientes se hubieran infectado antes de que desarrollaran la inmunidad. Estos datos justifican la necesidad de perseverar en el uso de equipo de protección personal, aun cuando no estamos seguros si estos deben ser usados en todo momento, aun cuando se esté al aire libre7 o después de haber sido vacunados. Por otro lado, se ha encontrado que una dosis de vacuna de COVID-19 m-RNA disminuye el riesgo hasta la mitad de que una persona transmita el SARS-CoV-2 a sus contactos más cercanos, de acuerdo con análisis de más de 365 mil hogares en el Reino Unido8. La necesidad de acelerar la vacunación para detener la diseminación de las variantes del virus con mayor capacidad de transmisión, comparada con la inicial, se confirma por el aumento de casos en poblacionesmás jóvenes. La curva de aprendizaje se regresa a los niveles iniciales en cuanto a las variantes más habituales en siete países europeos, incluyendo Italia: la inglesa (B.1.1.7), la Sur Africana (B.1.351) la brasileña (P. 1). La variante inglesa es la más extendida, incluyendo la población más joven (19.4 % 0-19 años, 31.3 % 20-29 años, 32.0 % 40-59 años). Representa un riesgo triple de hospitalización para el grupo de edad de 20-39 años y 2.3 veces más para el grupo de edad de 40-59, doblando el riesgo de necesitar cuidados intensivos para el grupo de edad de 40 599. Las investigaciones continúan y los tra bajos indexados en Medline bajo la palabra clave COVID-19, han alcanzado la increíble suma de 130 504 documentos. Aun cuando las investigaciones son bienes compartidos para la humanidad, no se puede decir lo mismo de las vacunas, que siguen estando protegidas por las patentes. En las palabras de Jeffrey Sachs, líder del Sistema de Redes del Desarrollo Sostenible, «Los beneficios de las vacunas mRNA… deberían ser accesibles globalmente y sin retraso; el conocimiento para producirlas debería ser compartido tan rápido y ampliamente posible. Tenemos la capacidad de inmunizar a nivel global con el fin de salvar vidas, prevenir el surgimiento de nuevas variables y terminar con la pandemia. La propiedad intelectual debe estar al beneficio del bien común global, y no siendo al revés, que la humanidad esté al servicio de los intereses de pocas compañías privadas»10. En un mundo globalizado, en el que las fronteras no significan nada para el virus, no es posible continuar creyendo que se debe eliminar la pandemia en un país o en un solo continente, olvidándose de los demás. Tal como lo dijo el Papa Francisco, en la triste tarde del 27 de marzo de 2020 durante su bendición, Urbi et Orbi, bajo una gran tormenta en la plaza desierta de San Pedro: «solo podemos salvarnos juntos».

show abstract

“…dari SARS-CoV-2. (14) Sudah menjadi kenyataan bahwa akibat pandemi COVID-19, banyak orang yang meninggal. Korban meninggal akibat COVID-19 terjadi baik pada orang yang memiliki penyakit penyerta maupun yang tidak memiliki penyakit penyerta.…”

unclassified

Virus Corona (SARS-CoV-2) penyebab COVID-19 kini telah bermutasi

Parwanto

2021

J Biomedika Kesehat

View full text Add to dashboard Cite

Telah dikemukakan bahwa virus corona menjadi penyebab COVID-19.(1) Virus corona yang dimaksud yaitu SARS-CoV-2, sedangkan COVID-19 kependekan dari corona virus disease-19. COVID-19 adalah penyakit yang disebabkan oleh SARS-CoV2 yang muncul awal Desember tahun 2019 di Wuhan, China. Sifat virus corona tersebut mudah menginfeksi manusia dan mudah menyebar hampir keseluruh penjuru dunia. Oleh karena itu terjadilah wabah (pandemi) COVID-19. Seiring berjalannya waktu, virus corona mengalami mutasi gen. Mutasi gen merupakan perubahan gen secara spontan dan bersifat turun menurun dari partikel virus induk ke partikel virus anakannya. Kita mengetahui bahwa gen virus corona terusun atas rangkaian ribo nucleic acid (RNA), oleh karena itu virus corona digolongkan sebagai virus RNA. Rangkaian gen pada virus corona tersebut menyusun genom virus corona. Genom virus corona mengandung 29 903 nukleotida (nt). Komponen genom virus corona yaitu 5’ untranslated region (5‘ UTR), rangkaian gen virus corona pengkode protein dan 3’ untranslated region (3’ UTR). Bagian 5’ UTR terdapat pada up stream (pangkal) sedangkan 3’ UTR terdapat di bagian down stream (ujung), keduanya tidak mengkode protein. Secara berurutan dari arah up stream ke down stream, rangkaian gen virus corona terdiri atas gen ORF 1ab, gen S, gen ORF 3a, gen E, gen M, gen ORF 6, gen ORF 7a, gen ORF 7b, gen ORF 8, gen N, gen ORF 10.(2)

show abstract

Characteristics of SARS-CoV-2 variants of concern B.1.1.7, B.1.351 or P.1: data from seven EU/EEA countries, weeks 38/2020 to 10/2021

Cited by 248 publications

References 7 publications

Risk of hospital admission for patients with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7: cohort analysis

Risk of hospital admission for patients with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7: cohort analysis

La larga y dolorosa curva de aprendizaje sobre COVID-19

Virus Corona (SARS-CoV-2) penyebab COVID-19 kini telah bermutasi

Contact Info

Product

Resources

About