Objetivo deste trabalho foi avaliar a inclusão de dois tipos de probiótico comercial, um complexo de bactérias e outro com Bacillus Subtillis em dietas para juvenis de tilápia do Nilo. Foram investigados os efeitos no desemprenho zootécnico, parâmetros hematológicos, concentração de glicose, morfologia intestinais e histomorfometria dos núcleos dos hepatócitos. Foram utilizados 96 juvenis, com peso médio inicial de 4,87±0,64 g e 6,50±0,2 cm de comprimento total, distribuídos aleatoriamente em 12 tanques de 18 L, com oito peixes em cada unidade experimental durante 53 dias, com diferentes tratamentos: (C) Controle; (CB) ração com complexo de bactérias; (BS) ração com B. subtilis. Entre os tratamentos não apresentaram diferença significativa no desempenho zootécnico da tilápia do Nilo. Para os parâmetros hematológicos, verificou-se diferença entre os tratamentos no número de eritrócitos, onde os peixes tratados com complexo de bactérias tiveram os maiores valores em relação aos grupos controle e B. subtilis, porém não teve alteração para os outros parâmetros sanguíneos. Na análise da composição centesimal não foi observado diferença significativa entre os tratamentos. As vilosidades intestinais foram maiores para CB em altura e largura dos vilos, porém a espessura da túnica foi maior no tratamento BS. A histomorfométrica dos núcleos dos hepatócitos os peixes tratados com CB tiveram maiores valores para área (μm²), perímetro (μm) e volume (μm³) dos núcleos. De acordo com os dados coletados, não há diferenças significativas entre aplicação de complexo de bactérias e B. subtilis.