Digital signal processing techniques to improve time resolution in positron emission tomography

Abstract

Rhinosinusitis is an inflammatory and obstructive process that affects the nasal cavity and sinuses. It's called chronic rhinosinusitis (CRS) when the disease lasts beyond 12 weeks. CRS can be associated with nasal polyps (CRSwNP) or not (CRSsNP). CRSwNP is a disease with high morbidity characterized by the existence of neoplastic structures that cause airways obstruction. Polyps are formed by the infiltration of inflammatory cells. Current treatments are ineffective in many of the patients having to undergo repeated surgical procedures therefore the developing of new and more effective drugs are necessary. Research in animal models is currently limited by the lack of diagnostic and disease monitoring methods without sacrificing animals. This study evaluates the effectiveness of the analysis of images carried out by computed tomography (CT) and positron emission tomography (PET) techniques in the diagnosis and monitoring of CSR-PN in an animal model. This animal model of the disease was obtained by an instillations protocol with ovalbumin as a sensitizer and Staphylococcus aureus enterotoxin B as inducing agent. CT technique is based on the ability of penetration of x-rays for detecting changes in tissue density. PET technique has the ability to calculate the glucose uptake by a homologous radiolabel. Tissue density and glucose uptake are properties that are altered in the course of a severe inflammatory process. The results obtained confirm the validity of these techniques to determine the existence of an inflammatory process and neoplastic structures in the developed disease model. The results obtained by the histological post-mortem analysis techniques corroborated this conclusion. It can be said that the use of CT and PET techniques is an effective method for determining and monitoring the evolution of CSRwPN in animal models in vivo, allowing the research into effective treatments for the disease. AgradecimientosEste trabajo es posible gracias a Xavi, quien creyó desde un primer momento que yo era la persona indicada para llevarlo a cabo y siempre sacó un momento para guiarme y aconsejarme en cada uno de los pasos de su realización.Mi agradecimiento, también, a los compañeros de la Fundación, que tanto me han ayudado a conseguir terminar un proyecto tan largo como este, en el tiempo estipulado, permitiéndome compaginarlo con el curso, así como prestándome su ayuda incondicional cuando me surgía alguna duda o me faltaba algún dato para poder seguir avanzando.A Rafa por ofrecerse a tutorizar este trabajo, permitiéndome poder desarrollarlo y defenderlo ante un tribunal.Por supuesto necesito también agradecer su apoyo a mi familia y amigos, especialmente a mi madre y a mi novia, Inma, pues sin su ayuda me hubiera sido mucho más difícil avanzar durante este largo periodo de trabajo, animándome siempre, ayudando cuando podían hacerlo y recordándome que a veces lo mejor para seguir a delante es despejarse un poco.Por último quiero dar gracias a mi padre por enseñarme, junto a mi madre, a ser lo que soy ho...

Estudio e implementación de algoritmos digitales para la mejora de la resolución temporal en sistemas de tomografía por emisión de positrones

“…Los resultados de esta investigación fueron publicados en [139,140,141]. Otro de los objetivos del presente trabajo fue observar el comportamiento y obtener la resolución temporal de los algoritmos propuestos en tiempo real en el sistema PET del estudio, implementando los métodos en la FPGA del sistema de adquisición.…”

“…Otro de los objetivos del presente trabajo fue observar el comportamiento y obtener la resolución temporal de los algoritmos propuestos en tiempo real en el sistema PET del estudio, implementando los métodos en la FPGA del sistema de adquisición. Los resultados presentados de esta parte fueron publicados en [141]. Los métodos que fueron estudiados en el presente trabajo pueden dividirse en dos grupos de algoritmos de extracción de tiempos diferentes, los basados en amplitud, que trabajan como un DCFD, y los basados en carga, que funcionan como un DARC.…”

“…Los métodos que fueron estudiados en el presente trabajo pueden dividirse en dos grupos de algoritmos de extracción de tiempos diferentes, los basados en amplitud, que trabajan como un DCFD, y los basados en carga, que funcionan como un DARC. Los basados en carga son originalmente propuestos en este estudio y han sido publicados en [139,141].…”

“…El trabajo presentado en el articulo de 2011 en la revista IEEE TRANSACTIONS ON NUCLEAR SCIENCIE [141] fue citado en los short courses "3. Integrated Circuits for Time and Amplitude Measurement of Nuclear Radiation Pulses" y "7.…”

Development of a data acquisition architecture with distributed synchronization for a Positron Emission Tomography system with integrated front-end.

“…The zero crossing point of b [n] is then obtained by interpolation, either linear [276] or cubic [277]. Additional signal processing steps are possible in order to refine the time estimation, like signal filtering, upsampling [278], and position-dependent correction using LUTs [279]. Moreover, all of the parameters involved in these steps may be reconfigured.…”