Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes among Patients with Chronic Hepatitis C Infection in Akdeniz University Hospital, Antalya, Turkey: A Five-Year Evaluation

Abstract

ÖZETHepatit C virusu (HCV) kronik hepatitlerin en önemli nedenlerinden biridir. HCV'ye bağlı kronik hepatitlerin seyrinde ve tedavinin planlanmasında HCV genotipleri önem taşımaktadır. Bu çalışmada, Akdeniz Üniversitesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında yapılan HCV genotiplendirilmesine ait sonuçların retrospektif olarak değerlendirilmesi ve son beş yıl içinde genotip dağılımındaki değişimin incelenmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, 2009-2013 yılları arasında laboratuvarımıza HCV genotip tayini için gönderilen, HCV-RNA pozitif kronik hepatit C'li 422 hastaya (219 erkek, 203 kadın; yaş aralığı: 8-79 yıl, yaş ortalaması 46.3 ± 15.5 yıl) ait kan örnekleri dahil edilmiştir. Genotiplendirme için, plazma örneklerinden HCV-RNA ekstraksiyonu otomatize sistem (EZ1 Virus Mini Kit v2.0, Qiagen, Almanya) ile yapılmış ve ters hibridizasyon esaslı ticari bir "line prob assay" (LIPA; GEN-C RT-PCR, İtalya) yöntemi uygulanmıştır. Viral yük tayini için ise, HCV-RNA düzeyleri gerçek zamanlı PCR yöntemi (Cobas TaqMan HCV, Roche Diagnostics, Almanya) ile araştırılmıştır. Hastaların demografik verileri, hastane elektronik bilgi sisteminden ve hasta dosyalarından elde edilmiştir. Hastaların %63.3 (n= 267)'ünde genotip 1b, %14.7 (n= 62)'sinde genotip 1a, %11.1 (n= 47)'inde genotip 3a, %0.9 (n= 4)'unda genotip 2b ve %0.2 (n= 1)'sinde genotip 4e saptanmış; 1 hastada (%0.2) ise genotip 1 ve 4 birlikteliği izlenmiştir. Genotip 1, 2 ve 4 ile enfekte hastaların sırasıyla; %5.4 (n= 23), %2.6 (n= 11) ve %1.4 (n= 6)'ünde alt tip tayini yapılamamıştır. Kırk hastanın yabancı uyruklu olduğu (Rusya'dan 16; Ukrayna ve Gürcistan'dan

The Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in Patients with Chronic Hepatitis C Infection

“…Dünyada Avrupa, Amerika, Japonya ve Orta Doğu ülkelerinde HCV genotiplerinin dağılımında farklılıklar görülebilmektedir (26,33). Son yıllarda Avrupa kaynaklı çalışmalarda genotip 1b, 2a ve 2c'de azalma, genotip 1a, 3a ve 4a'da artış belirlenmiştir.…”

“…Ülkemizde HCV genotiplerinin dağılımı ile ilgili olarak yapılan pek çok çalışmada farklı bölgelerde değişkenlik göstermekle birlikte, en sık rastlanan HCV genotipi, genotip 1b'dir. Genotip 1b'nin saptanma sıklığı %63,3-100 arasında değişmektedir (8)(9)(10)12,15,16,19,26,(34)(35)(36)(37)(38)(39)(40) Çalışmamızda farklı genotiplerin serum ALT düzeyine ve HCV-RNA kantitatif düzeylerine etkisinin olmadığı saptanmıştır (p>0,05). Bu sonuç, daha önce yapılan çalışma sonuçları ile uyumlu görünmektedir (13,14,22,24,27,34 …”

“…Genotip 1b'yi 1a izlemekte daha az oranlarda genotip 2, 3 ve 4 gözlenmektedir. Son yıllarda 2007'den beri özellikle genotip 3 ve 4 daha fazla oranlarda saptanmaktadır (18)(19)(20)(21)(22)(23)(24)(25)(26). HCV genotiplendirmesi, uygun tedavinin seçilmesi, tedavinin süresinin belirlenmesinde ve uygulanan tedaviye yanıtın izlenmesinde önemlidir (1).…”

Comparison of a novel real-time PCR method (RTA) and Artus RG for the quantification of HBV DNA and HCV RNA

“…This can also be partially ignored, because, according to the current data, genotype D of HBV is highly dominant in our country [15]. As for HCV, however, this factor may contribute to the observed differences between the results because, though genotype 1b is prevalent in Turkey, some other genotypes have also been emerging recently [16,17].…”

The Distribution of Hepatitis C Virus Genotypes in Patients With Chronic Hepatitis C Infection

“…Çalışmamızda, Haziran 2009 ve Şubat 2012 tarihleri arasında 108 kronik HCV hastasının genotiplendirilmesi sonucunda baskın genotipin 1b (%79) olduğu saptanmıştır. Genotip 2 prevalansı bölgesel farklılıklar göster-mekle birlikte yapılan çalışmalarda, %0.9-5 arasında bildirilmektedir (11)(12)(13)16,17,21,23,25,26) . Çalış-mamızda, genotip 2 %6.5 oranında yüksek oranda bulunmasına rağmen, genotip 2'nin son yıl-larda oldukça yüksek %14.5'e varan oranlarda bildirildiği çalışmalar da bulunmaktadır (27)(28)(29)(30) .…”