En este trabajo realizamos una evaluación del impacto del programa FEDER-Innterconecta (desarrollado en el marco del Fondo Tecnológico 2007-2013) en los principales indicadores de innovación empresarial en Galicia. De entre las diferentes líneas de actuación diseñadas, centramos el análisis en las dos primeras convocatorias gallegas del programa FEDER-Innterconecta pertenecientes a este “Programa Operativo por y para el beneficio de la I+D+i empresarial”, cuyo período de implementación abarca hasta el año 2015. El análisis propuesto trata de identificar la repercusión de la participación en dicho programa a partir de los principales indicadores microeconómicos disponibles (proyectos, fondos percibidos, evolución del gasto en investigación y desarrollo, innovación, patentes, redes de colaboración, facturación, etc.). Ese impacto se desglosa tomando en consideración el sector productivo al que pertenecen las empresas. Los resultados muestran un impacto desigual en función de las características empresariales y ponen de manifiesto la existencia de recursos gestionados por empresas domiciliadas en otros territorios. Estos resultados permitirán también formular recomendaciones para la ejecución futura de las políticas de investigación, desarrollo e innovación.