Στην παρούσα διατριβή μελετήθηκαν τα χαρακτηριστικά της φυσικής οργανικής ύλης (ΝΟΜ) του επιφανειακού νερού του ποταμού Αλιάκμονα που τροφοδοτεί την Εγκατάσταση Επεξεργασίας Νερού Θεσσαλονίκης (Ε.Ε.Ν.Θ.), η επίδραση σε αυτήν των διαφόρων σταδίων επεξεργασίας της εγκατάστασης και ο σχηματισμός οργανικών παραπροϊόντων κατά τη χλωρίωση και τον οζονισμό της. Πραγματοποιήθηκαν μηνιαίες δειγματοληψίες για ένα έτος από όλα τα στάδια επεξεργασίας της Ε.Ε.Ν.Θ. και εξετάστηκαν τα χαρακτηριστικά της ΝΟΜ (DOC, BDOC, UV254, SUVA και SFS) και ο σχηματισμός παραπροϊόντων απολύμανσης. Οι κύριες ομάδες παραπροϊόντων απολύμανσης που μελετήθηκαν ήταν οι καρβονυλικές ενώσεις ως παραπροϊόντα οζονισμού και το δυναμικό σχηματισμού τριαλογονομεθανίων και αλογονοξικών οξέων ως παραπροϊόντα χλωρίωσης. Επίσης, διερευνήθηκε η επίδραση αυτόχθονων και αλλόχθονων πηγών οργανικής ύλης στα χαρακτηριστικά της ΝΟΜ (DOC, BDOC, UV254, SUVA και SFS) και στη δυνατότητα σχηματισμού παραπροϊόντων απολύμανσης. Για το σκοπό αυτό πραγματοποιήθηκαν πειράματα οζονισμού και χλωρίωσης σε εργαστηριακό επίπεδο σε δείγματα επιφανειακού νερού του ποταμού Αλιάκμονα και μιγμάτων αυτού με επεξεργασμένα και ακατέργαστα αστικά λύματα, όπως επίσης και με χουμικά οξέα. Τέλος, πειράματα οζονισμού σε εργαστηριακό επίπεδο πραγματοποιήθηκαν σε δείγματα εσωκυτταρικής και εξωκυτταρικής οργανικής ύλης δυο στελεχών κυανοβακτηρίων που συναντώνται με υψηλή συχνότητα στον ποταμό Αλιάκμονα (Microcystis flos-aquae TAU-MAC 1510 και Anabaena sp. TAU-MAC 2610). Τα δείγματα της βιολογικής οργανικής ύλης οζονίστηκαν στο εργαστήριο σε διαφορετικές συνθήκες δόσης όζοντος και χρόνου επαφής και προσδιορίστηκαν οι μεταβολές των χαρακτηριστικών της οργανικής ύλης (DOC, URI, UV254 και SFS) και της συγκέντρωσης των καρβονυλικών ενώσεων ως παραπροϊόντων οζονισμού. Πιθανές συσχετίσεις μεταξύ των διαφόρων παραμέτρων και των μεταβολών τους μελετήθηκαν με την εφαρμογή στατιστικών εργαλείων.