Genetic profile of the Açores Archipelago population using the new PowerPlex®16 System Kit

Velosa, Rute; Fernandes, Ana; Brehm, António

doi:10.1016/s0379-0738(02)00203-7

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“…The acumulated PEX is 0.999999940. The observed allele frequency distribution in the sample analysed didn't show significant differences from other populations with similar origins like those reported for Madeira [5] and Açores Archipelagos [6]. Some alleles found in those populations were absent in our study.…”

supporting

confidence: 68%

Allele frequencies of sixteen STRs in the population of Northern Portugal

Pinheiro

Cainé

Pontes

et al. 2005

Forensic Science International

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confidence: 68%

Allele frequencies of sixteen STRs in the population of Northern Portugal

Pinheiro

Cainé

Pontes

et al. 2005

Forensic Science International

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“…A neighbor-joining tree was constructed based upon the 6 STR allele frequencies in our sampled population and from populations from Central Portugal (Manco et al, 2007(Manco et al, /2008, North Portugal (Pinheiro et al, 2005), Madeira , Azores (Velosa et al, 2002), Cabinda (Beleza et al, 2004), Mozambique , Equatorial Guinea (Alves et al, 2005) and Guinea-Bissau (Gonçalves et al, 2002) (Figure 1). Figure 1.…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

“…Allele frequencies from Cabinda (Beleza et al, 2004), Mozambique , Equatorial Guinea (Alves et al, 2005) and Guinea-Bissau (Gonçalves et al, 2002) were used for genetic differentiation tests with São Tomé e Principe population sample, applying the Bonferroni correction for multiple tests (Hochberg, 1988). A neighbor-joining tree was constructed using the PHYLIP3.5c software package (Felsenstein, 1993) based on Reynolds Genetic distance (Reynolds et al, 1983) with a bootstrap of 10000 resamples, using population data from different Portuguese regions, Central Portugal (Manco et al 2007(Manco et al -2008, North Portugal (Pinheiro et al, 2005), Madeira , Azores (Velosa et al, 2002), and from other African populations, Cabinda (Beleza et al, 2004), Mozambique , Equatorial Guinea (Alves et al, 2005) and Guinea-Bissau (Gonçalves et al, 2002).…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

Allele frequencies of 6 STR loci (TH01, TPOX, CSF1PO, D13S317, D16S539 and D7S820) in São Tomé e Príncipe (West Africa)

Manco

Silva²,

Arede³

et al. 2011

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Resumo As frequências alélicas de seis marcadores autossómicos do tipo short tandem repeat (STR) (TH01, TPOX, CSF1PO, D13S317, D7S820 e D16S539) foram estimadas numa amostra populacional (N=53-85) de São Tomé e Príncipe (África Ocidental). Não foram encontrados desvios significativos ao equilíbrio de HardyWeinberg em qualquer dos loci. A distribuição de frequências e valores de heterozigotia são semelhantes aos encontrados noutras populações Africanas sub-Saarianas.Palavras-chave São Tomé e Príncipe; short tandem repeats (STRs); genética populacional.Abstract Allele frequencies of six autosomal short tandem repeat (STR) markers (TH01, TPOX, CSF1PO, D13S317, D7S820 and D16S539) were estimated in a population sample (N=53-85) of unrelated individuals from São Tomé e Principe (West Africa). No deviations from Hardy-Weinberg equilibrium were observed for all loci. Allele frequency distribution and heterozygosity values were similar with those from other sub-Saharan African populations.

show abstract

“…O teste exacto de diferenciação com base nas frequências alélicas revelou não haver diferenças estatisticamente significativas entre as frequências alélicas obtidas na região Centro de Portugal e noutras amostras da população Portuguesa, nomeadamente da região Norte Amorim et al, 2001;Fernandes e Brehm, 2002;Pinheiro et al, 2005), Centro (Fernandes e Brehm, 2002), Sul (Fernandes e Brehm, 2002), Madeira e Açores (Velosa et al, 2002), com excepção do marcador TPOX relativamente à amostra populacional da Madeira e a uma amostra populacional da região Norte (Fernandes e Brehm, 2002) (P<0,05) (Tabela 2). As frequências alélicas obtidas para os 6 loci foram também comparadas com as de outras populações Europeias, nomeadamente de Espanha -País Basco e Andaluzia (Pérez-Miranda e Herrera, 2005), Grécia (Kovatsi et al, 2005), Polónia (Czarny et al, 2005) e Itália (Garofano et al, 1998), tendo sido obtidas diferenças estatisticamente significativas para diversos marcadores (P<0,05).…”

Section: Resultsunclassified

“…Diversos estudos de genética populacional utilizando microssatélites têm vindo a ser realizados em amostras da população Portuguesa, nomeadamente na região Norte de Portugal Amorim et al, 2001;Pinheiro et al, 2005), Madeira e Açores (Velosa et al, 2002). Todavia, na região Centro e Sul do país os estudos disponíveis utilizando STRs autossómicos são escassos (Fernandes e Brehm, 2002).…”

Section: Introductionunclassified

Estudo populacional de 6 STRs (TH01, TPOX, CSF1PO, D7S820, D13S317 e D16S539) na região Centro de Portugal

Manco¹,

Arede²,

Silva³

et al. 2008

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Genetic profile of the Açores Archipelago population using the new PowerPlex®16 System Kit

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Allele frequencies of sixteen STRs in the population of Northern Portugal

Allele frequencies of sixteen STRs in the population of Northern Portugal

Allele frequencies of 6 STR loci (TH01, TPOX, CSF1PO, D13S317, D16S539 and D7S820) in São Tomé e Príncipe (West Africa)

Estudo populacional de 6 STRs (TH01, TPOX, CSF1PO, D7S820, D13S317 e D16S539) na região Centro de Portugal

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