Hereditary Breast-Ovarian Cancer and BRCA1 / BRCA2 variants: a single center experience

Gezdırıcı, Alper; İli, Ezgi Gökpınar; Değirmenci, Banu; Gümüş, Aydeniz Aydın; Özdemir, Gazi; Erman, Nihan Alişya; Yavas, C.

doi:10.5505/aot.2021.25348

Cited by 7 publications

(6 citation statements)

References 0 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Order By: Relevance

“…In another study conducted in 2020 by Demir S et al in the Thrace region of Turkey, a total of 493 participants were analyzed, of which 442 were diagnosed with breast/ovarian cancer, and 51 were not diagnosed with any clinical cancer but had a family history. Among all participants in this study, the frequency of pathogenic/likely pathogenic mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes was 17.84%, while the frequency in participants with breast/ovarian cancer was 19.23% (85/442) (26). BRCA1 and BRCA2 mutations prevelance was studied in high-risk breast ca individuals in Jordan in 2020.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 94%

Spectrum of Germline Cancer Susceptibility Gene Mutations in Breast and Ovarian Cancer Patients in the Black Sea Region of Turkey: Single Center Experience

Çitli

Dagcıoğlu

Aydın

et al. 2023

esmj

View full text Add to dashboard Cite

Introduction: Breast cancer consists huge amount of the cancerrelated death in population. Ovarian cancer is the second most frequent seen type of gynecological cancer and has the highest mortality among gynecological cancers since most cases are detected late. The current study intended to determine the prevalence of oncogene mutations, especially BRCA1 and BRCA2, in high-risk patients diagnosed with ovarian and breast cancer in the Black Sea region of our country. Material and method: Between August 2017 and January 2022, a total of 223 individuals who applied to our center and met the genetic test criteria were included in the study. Next-generation sequencing (NGS) was used to detect germ-line deleterious variants in genes included in the oncogenetic panel of patients (34 genes). Results: Among the 223 patients analyzed within the scope of the study, 195 had breast cancer, and 28 had ovarian cancer, resulting in the detection of 15 different pathogenic variants of BRCA1 (%4,9) and BRCA2 (%6,7) genes in 26 (11.6%) patients. In the analysis of 32 oncogenes other than BRCA1 and BRCA2 genes, 26 different pathogenic (P) or likely pathogenic (LP) variants were detected in a total of 35 patients (15.7%). Based on the analysis of 223 breast/ ovarian cancer patients together, 41 different pathogenic (P) or likely pathogenic (LP) variants were found in 61 patients (27.3%). Furthermore, 65 different VUSs (Variant of Uncertain Significance) were detected in 73 patients (32.7%). Conclusion: This is the first study to be conducted in our region in a single center located in the Black Sea region. The study was conducted in a single center within the Black Sea region and, to our knowledge, provides the first data in this region in terms of cancer genes other than BRCAs. To appreciate of the genetic susceptibility spectrum of hereditary breast and/or ovarian cancer better, it is imperative to clarify the risks associated with genes other than BRCAs, which carry a high risk for other breast and ovarian cancers, as well as BRCA1 and BRCA2. Therefore, patients in the risk group must undergo multigene panel testing in addition to routine BRCA1 and BRCA2 gene testing. We detected two novel variants in the BRCA2 gene and five novel variants other than BRCA oncogenes. Furthermore, the results of this study contributed to the development of our country's specific variant pool.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 94%

Spectrum of Germline Cancer Susceptibility Gene Mutations in Breast and Ovarian Cancer Patients in the Black Sea Region of Turkey: Single Center Experience

Çitli

Dagcıoğlu

Aydın

et al. 2023

esmj

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Tüm varyantlar (P/LP/VUS/CNV) değerlendirildiğinde ise bu oran %14,89 (28/188) olup, İstanbul'da NCNN kılavuzuna göre seçilen HBOC veya HBOC riski olan 149 bireyin dâhil edildiği BRCA1/BRCA2 genlerinde P/LP/VUS/CNV varyant oranının %26,1 olarak bulunduğu çalışmaya göre daha düşüktür. 15 Çalışmamıza dâhil edilen bireylerin akraba olmayışı ve farklı ailelerden olmaları nedeniyle oranın Gezdirici ve ark.nın çalışmasına göre nispeten daha düşük olduğu düşünülmektedir. Balıkesir'de HBOC sendromu nedeniyle değerlendirilen 120 birey ile yapılan başka bir çalışmada ise çalışmamızla benzer şekilde %16,66 oranında BRCA1/BRCA2 genlerinde P/LP/VUS/CNV varyant tespit edilmiştir.…”

Section: Discussionunclassified

“…Balıkesir'de HBOC sendromu nedeniyle değerlendirilen 120 birey ile yapılan başka bir çalışmada ise çalışmamızla benzer şekilde %16,66 oranında BRCA1/BRCA2 genlerinde P/LP/VUS/CNV varyant tespit edilmiştir. 15 Gerik-Çelebi ve Bolat'ın çalışmasında tespit edilen varyantların %3,33'ü, Bahsi ve Erdem'in çalışmasında tespit ettikleri varyantların ise %6,4'ü VUS idi. 16,17 Çalışmamızda VUS varyant oranı benzer şekilde %4,25 idi.…”

Section: Discussionunclassified

Evaluation of BRCA1/BRCA2 Results in Individuals Diagnosed with and at Risk for Hereditary Breast Cancer: Variant Frequency, Distribution and Four Novel Variants (Retrospective Cohort Study)

BAŞDEMİRCİ,

BALASAR

2024

Turkiye Klinikleri J Med Sci

View full text Add to dashboard Cite

Bu çalışmanın amacı, herediter meme kanseri tanısı ve herediter meme ve/veya over kanseri [hereditary breast and over cancer (HBOC)] riski ile başvuran bireylerin BRCA1/2 genlerindeki germline varyant sıklığının, dağılımının ve yeni varyantların değerlendirilmesidir. Gereç ve Yöntemler: Çalışma retrospektif bir çalışma olup, Ulusal Kapsamlı Kanser Ağı kılavuzlarına göre genetik analiz yapılması önerilen aralarında akrabalık bulunmayan 147 meme kanserli birey ve 41 sağlıklı birey dâhil edilmiştir. BRCA1/2 genlerindeki tek nükleotid değişimi, küçük delesyon/duplikasyon tespiti için yeni nesil dizileme yapılmıştır. Büyük delesyon/duplikasyonlar ve kopya sayısı değişiklikleri için multipleks ligasyona bağlı prob amplifikasyonu yöntemi kullanılmıştır. Bulgular: Kanserli olguların 20'sinde (%13,6), sağlıklı olguların ise 8'inde (%19,5) olmak üzere, çalışmaya dâhil edilen toplam 188 olgunun 28'inde (%14,89) BRCA1 ve/veya BRCA2 geninde heterozigot varyant [patojenik (P), muhtemel patojenik (likely pathogenic "LP"), klinik önemi belirsiz (variants of uncertain significance "VUS"), kopya sayısı değişikliği (copy number variation "CNV")] tespit edildi. Tüm olguların 20'si (%10,64), BRCA1 (n=12, %7,95) veya BRCA2 (n=8, %4,24) geninde P/LP/CNV varyant taşırken 8 olguda (%4,25) VUS varyant vardı. Olgularda en sık görülen varyant BRCA1 genindeki c.5266dupC idi. BRCA1 geninde bir yeni varyant (p.Pro1575Ala), BRCA2 geninde 3 yeni varyant (p.Lys2950ArgfsTer26, p.Ser973AspfsTer41, p.Gly1700Leu) tespit edildi. Sonuç: Çalışmamızda BRCA1/2 genlerinde %14,89 olarak bulunan germline varyant sıklığı Türkiye'de yapılan önceki çalışmalara benzerdi. Tespit edilen 4 yeni varyant, genetik spektrumun genişletilmesine katkı sağladı. HBOC'li ya da riskli bireylerde BRCA1/2 gen analizi tanı konulmuş hastalarda tedavi yönetiminin planlanması, yüksek riskli sağlıklı bireylerde ise kanser gelişimine karşı riski azaltıcı önlemlerin alınması, bu bireylere erken tanı konulması ve genetik danışmanlık verilmesi açısından oldukça önemlidir. Anah tarKe li me ler: Ailesel meme kanseri; BRCA1; BRCA2; germline varyant ABS TRACT Objective: The aim of this study is to evaluate the frequency and distribution of germline variants and novel variants in the BRCA1 and BRCA2 genes of individuals presenting with the diagnosis of hereditary breast cancer and hereditary breast and over cancer (HBOC) risk. Material and Methods: A total of 147 unrelated cancer individuals and 41 healthy individuals, whose genetic analysis was recommended according to the National Comprehensive Cancer Network guidelines, were included in the study. Next generation sequencing was performed to detect single nucleotide change, small deletion/duplication in BRCA1 and BRCA2 genes. The multiplex ligation-dependent probe amplification method was used for large deletions/duplications and copy number changes. Results: Heterozygous variant [pathogenic (P), likely pathogenic (LP), variants of uncertain significance (VUS), copy number variation (CNV)] was detected in BRCA1 and/or BRCA2 genes in 28 (14...

show abstract

“…Geleneksel yöntemlerle çok sayıda etkilenmiş bireye sahip geniş aileler olmadan fenotipik ve genotipik heterojenite gösteren hastalıkların yeni nesil dizileme teknolojileri ile moleküler genetik temelinin ortaya konması mümkün hale gelmektedir. Yeni nesil dizileme teknolojileri ile HBA1 VE HBA2 genleri hızlı bir şekilde ve düşük maliyette analizi yapılabilmektedir (36)(37)(38)(39)(40)(41)(42)(43).…”

Section: Discussionunclassified

The Genotypes of α-Thalassemia and Genotypes Frequencies of α- Thalassemia in Western Aegean Region

Barış

YAVAŞ

Balasar³

et al. 2023

Sağlık Bilimlerinde Değer

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Amaç: Yaygın görülen bir tek gen hastalığı olan Alfa talasemi, α-globin zincirinin kusurlu sentezi ile ortaya çıkar. Globin genlerindeki bozukluklara bağlı olarak çok geniş bir klinik spektruma yayılan bu hastalıkta çok sayıda belirlenmemiş taşıyıcı olduğu düşünülmektedir. Klinik semptomu olmayan sessiz taşıyıcılardan, rahim içinde ölüme yol açan şiddetli anemi ile kendini gösteren, çok değişken bulgulara sahip genetik bir hastalıktır. Bu çalışmada bu amaçla alfa globin gen mutasyonu sıklığının ve tiplerinin bulunması ve varyasyon saptanan bireylerdeki fenotipik etkiyi görmek amaçlandı. Gereç ve Yöntemler: HBA1 ve HBA2 genlerindeki intron bölgelerini çevreleyen tüm kodlama bölgesi sanger dizileme ile tespit edildi. Delesyonlar ve duplikasyonlar multipleks ligasyona bağımlı prob amplifikasyonu (MLPA) ile mutasyonlar tespit edildi. Bulgular: Bölgemizde en sık rastlanan mutasyon tipi olan -3,7 / (%23,18), 3.7 kb’lık delesyon çalışmamızda da en sık olarak görülürken, diğer mutasyonların dağılımı ise --3,7 (%6,82), -3,7/-- MED (%0,91), --MED (%6,82), --20,5 (3,15), --SEA (%1,36), -4,2 (%0,95), triplikasyon (%0,45) ve nükleotid değişimleri (%4,55) olarak tespit edilmiştir. Sonuç: Mevcut bilgiler ışığında genotipin fenotipe yansımasının da farklılıklar olması nedeniyle taşıyıcı bireylerin tesbit edilmesi ve genotip fenotip ilişkisinin netleştirilmesi açısından daha geniş popülasyon taramasına ihtiyaç duyulmaktadır. Toplumu alfa talasemi ve ağır klinik seyreden genetik hastalıklar hakkında bilinçlendirmek için taşıyıcı bireylere genetik danışmanlık verilmesi ve genetik çalışmalara ağırlık verilmesi bir gerekliliktir.

show abstract

Hereditary Breast-Ovarian Cancer and BRCA1 / BRCA2 variants: a single center experience

Cited by 7 publications

References 0 publications

Spectrum of Germline Cancer Susceptibility Gene Mutations in Breast and Ovarian Cancer Patients in the Black Sea Region of Turkey: Single Center Experience

Spectrum of Germline Cancer Susceptibility Gene Mutations in Breast and Ovarian Cancer Patients in the Black Sea Region of Turkey: Single Center Experience

Evaluation of BRCA1/BRCA2 Results in Individuals Diagnosed with and at Risk for Hereditary Breast Cancer: Variant Frequency, Distribution and Four Novel Variants (Retrospective Cohort Study)

The Genotypes of α-Thalassemia and Genotypes Frequencies of α- Thalassemia in Western Aegean Region

Contact Info

Product

Resources

About