Search citation statements
Paper Sections
Citation Types
Year Published
Publication Types
Relationship
Authors
Journals
Günümüzde, doğadan gelen ve fitokimyasal özelliğe sahip bileşikler (antioksidan, antimikrobiyal, antikanser, vb.) yan etkilerinin olmaması nedeniyle insan dostu ilaçlar olarak kabul edilirler. Bu nedenle bitkilerde de bulunan bu doğal antioksidan bileşiklere verilen önem her geçen gün artarak devam etmektedir. Pelargonium taksonları da solunum yolu enfeksiyonları, dizanteri, karaciğer şikayetleri ve ishal tedavisi, vb hastalıklarda iyileştirici olarak kullanılmaktadır. Bitki doku ve hücre kültürleri, polifenoller gibi bazı aktif metabolitlerin üretilmesi için iyi bir araçtır. Bu yöntemler ile sekonder metabolit üretiminin teşvik edildiği ve antioksidan kapasitede değişiklikler olduğu da bilinmektedir. Bu kapsamda araştırmamızda, Pelargonium quercetorum Agnew bitkisi in vivo (rizom ve toprak üstü kısım) ve in vitro şartlarda yetiştirilerek toplam fenolik, flavonoid ve antioksidan kapasitelerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Elde edilen sonuçlar incelendiğinde, en yüksek fenolik ve flavonoid içerik in vitro sürgün ekstresinde; en düşük fenolik ve flavonoid içerik ise rizom ekstresinde tespit edilmiştir. Araştırmamızda toplam antioksidan aktiviteyi belirlemek amacıyla 3 farklı yöntem (DPPH, ABTS, CUPRAC) kullanılmıştır. Antioksidan aktivite sonuçları genel olarak değerlendirildiğinde, her üç yöntemde de aktivite sıralamasının “in vitro sürgün ˃ in vivo toprak üstü ˃ in vivo rizom” şeklinde olduğu gözlenmiştir. DPPH yönteminde bitki ekstreleri pozitif kontrol olarak kullanılan BHT’ye göre, ABTS yönteminde ise BHA’ya göre daha iyi aktivite göstermiştir. Ayrıca toplam fenolik-flavonoid içerik ile antioksidan aktivite arasında pozitif korelasyon olduğu görülmüştür. Bu çalışmadan elde edilen veriler, P. quercetorum bitkisinin antioksidan aktiviteye sahip olduğunu, doğal kaynaklı antioksidan ve inhibitör madde arayışında çalışmamızın bir basamak olacağı düşünülmektedir.
Günümüzde, doğadan gelen ve fitokimyasal özelliğe sahip bileşikler (antioksidan, antimikrobiyal, antikanser, vb.) yan etkilerinin olmaması nedeniyle insan dostu ilaçlar olarak kabul edilirler. Bu nedenle bitkilerde de bulunan bu doğal antioksidan bileşiklere verilen önem her geçen gün artarak devam etmektedir. Pelargonium taksonları da solunum yolu enfeksiyonları, dizanteri, karaciğer şikayetleri ve ishal tedavisi, vb hastalıklarda iyileştirici olarak kullanılmaktadır. Bitki doku ve hücre kültürleri, polifenoller gibi bazı aktif metabolitlerin üretilmesi için iyi bir araçtır. Bu yöntemler ile sekonder metabolit üretiminin teşvik edildiği ve antioksidan kapasitede değişiklikler olduğu da bilinmektedir. Bu kapsamda araştırmamızda, Pelargonium quercetorum Agnew bitkisi in vivo (rizom ve toprak üstü kısım) ve in vitro şartlarda yetiştirilerek toplam fenolik, flavonoid ve antioksidan kapasitelerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Elde edilen sonuçlar incelendiğinde, en yüksek fenolik ve flavonoid içerik in vitro sürgün ekstresinde; en düşük fenolik ve flavonoid içerik ise rizom ekstresinde tespit edilmiştir. Araştırmamızda toplam antioksidan aktiviteyi belirlemek amacıyla 3 farklı yöntem (DPPH, ABTS, CUPRAC) kullanılmıştır. Antioksidan aktivite sonuçları genel olarak değerlendirildiğinde, her üç yöntemde de aktivite sıralamasının “in vitro sürgün ˃ in vivo toprak üstü ˃ in vivo rizom” şeklinde olduğu gözlenmiştir. DPPH yönteminde bitki ekstreleri pozitif kontrol olarak kullanılan BHT’ye göre, ABTS yönteminde ise BHA’ya göre daha iyi aktivite göstermiştir. Ayrıca toplam fenolik-flavonoid içerik ile antioksidan aktivite arasında pozitif korelasyon olduğu görülmüştür. Bu çalışmadan elde edilen veriler, P. quercetorum bitkisinin antioksidan aktiviteye sahip olduğunu, doğal kaynaklı antioksidan ve inhibitör madde arayışında çalışmamızın bir basamak olacağı düşünülmektedir.
Background: A genome-scale metabolic network model (GEM) is a mathematical representation of an organism's metabolism. Today, GEMs are popular tools for computationally simulating the biotechnological processes and for predicting biochemical properties of (engineered) strains. Objectives: In the present study, we have evaluated the predictive power of two GEMs, namely iBsu1103 (for Bacillus subtilis 168) and iMZ1055 (for Bacillus megaterium WSH002). Materials and Methods: For comparing the predictive power of Bacillus subtilis and Bacillus megaterium GEMs, experimental data were obtained from previous wet-lab studies included in PubMed. By using these data, we set the environmental, stoichiometric and thermodynamic constraints on the models, and FBA is performed to predict the biomass production rate, and the values of other fluxes. For simulating experimental conditions in this study, COBRA toolbox was used. Results: By using the wealth of data in the literature, we evaluated the accuracy of in silico simulations of these GEMs. Our results suggest that there are some errors in these two models which make them unreliable for predicting the biochemical capabilities of these species. The inconsistencies between experimental and computational data are even greater where B. subtilis and B. megaterium do not have similar phenotypes. Conclusions: Our analysis suggests that literature-based improvement of genome-scale metabolic network models of the two Bacillus species is essential if these models are to be successfully applied in biotechnology and metabolic engineering.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
customersupport@researchsolutions.com
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.