A alimentação escolar é de fundamental importância no processo de aprendizagem desde os primeiros anos da vida. Nas cantinas escolares há uma intensa produção e manipulação de alimentos, o que demonstra a necessidade da implementação das Boas Práticas de Fabricação para garantir a qualidade dos produtos ofertados. Neste contexto, a presente pesquisa teve como objetivo avaliar as Boas Práticas de Fabricação em uma cantina de uma escola do Município de Missão Velha-CE. Trata-se de uma pesquisa de natureza quantitativa, descritiva, realizada em uma cantina de uma escola de ensino fundamental localizada na zona rural do município de Missão Velha-CE. A pesquisa foi realizada no período de agosto a setembro de 2017, utilizando como instrumento para coletas de dados um checklist baseado na resolução RDC nº275/2002. Após aplicação do checklist foi realizado um treinamento sobre boas práticas na manipulação de alimentos aos manipuladores. Os percentuais de inadequação nas escolas variaram entre 22,59% a 48,39%, mostrando o descumprimento da legislação vigente. Com base nesse contexto, vale ressaltar a importância do treinamento e orientação continuada dos funcionários para que conheçam e cumpram as condutas e as limitações existentes, garantindo o objetivo de eliminar, diminuir ou prevenir riscos à saúde e nesse caso, das escolas, intervir nos possíveis problemas sanitários em todas as etapas e processos, da produção ao consumo da merenda escolar.