Résumé -Les filières agricoles connaissent une importante restructuration, se traduisant par une déconnexion de plus en plus forte entre opérateurs des filières et ceux des territoires, et entre lieux de production et usages des ressources locales. Les filières utilisent des ressources des territoires, mais n'y opèrent souvent qu'une partie de leur activité, et ne se soucient pas toujours de leur impact local, environnemental comme socioéconomique. Des acteurs de territoires, porteurs quant à eux d'enjeux de développement socioéconomique et environnementaux, sont inquiets des incidences de ces transformations et s'interrogent sur la possibilité de re-territorialiser certaines filières. Pour alimenter les réflexions de ces acteurs, nous cherchons à mieux comprendre les interactions entre filières agricoles et territoires, notamment les interactions entre les flux générés, les écosystèmes, et les systèmes d'acteurs qui les pilotent. L'écologie territoriale, champ de recherche interdisciplinaire, vise à mieux comprendre les modalités des interactions entre sociétés et environnement, notamment les relations entre la structuration des flux (matériels et énergétiques) et l'organisation sociale, politique, économique à l'échelle de territoires, à partir de la notion de métabolisme. Nous présentons ici une exploration de ce champ de recherche, ainsi que des champs de recherche affiliés, par des chercheurs en agronomie, en dialogue avec un chercheur en écologie territoriale. Nous explicitons les notions et présentons ce que nous en avons retenu pour élaborer un cadre d'analyse des interactions entre filières et territoires, s'appuyant sur les notions d'ancrage, de dépendance et d'empreinte. Nous discutons des intérêts et limites de l'approche dans le champ de l'agronomie et à l'échelle des territoires. what concepts and framework of analysis. The agricultural value chains are facing an important restructuring, which translates in a more and more important disconnection between operators of the supply chains and those of the territories, and between places of production and uses of the local resources. Supply chains use local resources, but often operate only a part of their activity there, and do not always care about their local impact, either environmental or socioeconomic. Actors of territories, as environmental and socioeconomic stakeholders, are worried about incidences of these transformations and question the possibility to re-localize parts of the value chains. To feed the reflections of local actors, we seek to better understand the interactions between agricultural value chains and territories, in particular the interactions between the generated flows, the ecosystems, and the systems of actors, which pilot them. Territorial ecology, an interdisciplinary research field, aims at understanding modalities of interactions between societies and environment, and especially relations and correlations between flows (materials and energy) and the social, political, and economic organization at territorial scale, buildin...