Изучение Генетического Сходства Донских Аборигенных Сортов Винограда С Применением SSR-Анализа И По Основным Ампелографическим Признакам Листа

Ильницкая, Е. Т.; Токмаков, С.В.; Супрун, И. И.; Naumova, L. G.; Ganich, Valentina Alekseyevna

doi:10.15389/agrobiology.2016.1.60rus

Cited by 1 publication

(2 citation statements)

References 0 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…По изучению ряда стародавних южнороссийских сортов винограда также были проведены молекулярно-генетические исследования [19][20][21][22][23][24][25]. из коллекции института «Магарач» прогенотипированы 76 образцов крымских автохтонных сортов винограда с использованием 22 ядерных и 3-х хлоропластных микросателлитных локусов [21].…”

Section: O R I G I N a L R E S E A R C Hunclassified

“…Анализ проводили маркерными парами: VVS2 + VVMD7; VVMD27 + VVMD5; VrZAG62 + VrZAG79. Указанные пары SSR-маркеров были сформированы и апробированы нами ранее с учетом температуры отжига праймерных пар и литературных данных о диапазонах размеров амплифицируемых фрагментов по конкретным локусам; в одном наборе использовали два различных флуоресцентных красителя праймеров (FAM, TAMRA, ROX или R6G), что позволяет идентифицировать ПЦР-продукт по каждому конкретному маркеру [23]. использование мультиплексных пар при днК-анализе позволяет оптимизировать время и расход реактивов, необходимых для работы.…”

Section: O R I G I N a L R E S E A R C Hunclassified

See 1 more Smart Citation

Генетический Полиморфизм Редких И Малораспространенных Аборигенных Донских Генотипов L

Ilnitskaya¹,

Naumova²,

Ganich³

et al. 2019

Magarach. Vinogradstvo I Vinodelie

View full text Add to dashboard Cite

История виноградарства на Дону насчитывает несколько веков, местные сорта винограда многообразны и специфичны. Микросателлитные маркеры широко используются для генотипирования сортов и подвоев винограда, при изучении происхождения сортов и анализе их родословной. Целью исследования было изучение выборки редких и малораспространенных автохтонных донских сортов и сравнение их с другими аборигенными донскими генотипами на основе данных ДНК-анализа. В исследования включены 23 стародавних донских сорта. Генотипирование проводили методом микросателлитного профилирования. В исследовании использовали микросателлитные маркеры (SSR), рекомендованные в качестве основного минимального набора для ДНК-паспортизации сортов вида Vitis vinifera L.: VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVS2, VrZAG62 и VrZAG79. По результатам проведенного анализа все изученные образцы показали сорт-специфическую комбинацию аллелей в идентифицированных ДНК-профилях. Количество выявленных аллелей составило в среднем 8 аллелей/локус. Наибольший полиморфизм в исследовании этой группы донских сортов был обнаружен в локусе VVMD5: идентифицировано 10 аллелей на локус, наименьшее - в локусе VrZAG62: 6 аллелей/локус. Основываясь на данных SSR-анализа, степень генетического сходства сортов оценивали с использованием метода UPGMA. Кластерный анализ матрицы генетических дистанций, созданный на основе выявленных значений аллелей в шести микросателлитных локусах исследуемых сортов, определил несколько групп генотипов. Сорт Красностоп золотовский выделился в отдельную ветвь, что указывает на различия между этим генотипом и другими сортами исследуемой выборки. Наивысший уровень генетического сходства наблюдался между следующими парами сортов: Крестовский и Бургундский, Шилохвостый и Мушкетный, Кумшацкий черный и Ефремовский.The history of viticulture on the Don goes back several centuries. Local grapevine varieties are diverse and peculiar. Microsatellite markers are widely used in genotyping grapevine cultivars and rootstocks, in grapevine origin and breeding background analysis. Our study aimed to examine samples of rare and less common autochthonous Don varieties, and compare them with the other aboriginal Don genotypes using DNA data. The study involved 23 traditional Don varieties. The genotyping was done by microsatellite profiling. The study used microsatellite (SSR) markers recommended as the basic minimum set for DNA-certification of the genotypes of Vitis vinifera L.: VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVS2, VrZAG62 and VrZAG79. Based on the findings, all the studied samples demonstrated variety-specific combination of alleles in the identified DNA profiles. The number of detected alleles on average was 8 alleles/locus. The greatest polymorphism in the studied group of Don varieties was detected in VVMD5 locus: 10 alleles per locus were identified, the smallest in VrZAG62 locus: 6 alleles/locus. UPGMA method was used to assess the extent of genetic similarity of the varieties based on SSR-genotyping data. Based on determined allele values of the studied varieties, cluster analysis of the genetic distances matrix determined several groups of genotypes. ‘Krasnostop zolotovskiy’ variety stood out as a separate branch, which indicates the difference between this genotype and the other varieties of the studied sampling. The highest level of genetic similarity was observed between the following pairs of varieties: ‘Krestovskiy’ and ‘Burgundskiy’, ‘Shilohvostyi’ and ‘Mushketnyi’, ‘Kumshatskiy chornyi’ and ‘Efremovskiy’.

show abstract

Section: O R I G I N a L R E S E A R C Hunclassified