The objectives of the present study were to investigate the rate of S.aureus nasal carriage and molecular characteristics in hospital and community settings in Bobo Dioulasso, Burkina Faso. Nasal samples (n = 219) were collected from 116 healthy volunteers and 103 hospitalized patients in July and August 2014. Samples were first screened using CHROMagar Staph aureus chromogenic agar plates, and S. aureus strains were identified by mass spectrometry. Antibiotic susceptibility was tested using the disk diffusion method on Müller-Hinton agar. All S. aureus isolates were genotyped using DNA microarray. Overall, the rate of S. aureus nasal carriage was 32.9% (72/219) with 29% in healthy volunteers and 37% in hospital patients. Among the S. aureus isolates, only four methicillin-resistant S. aureus (MRSA) strains were identified and all in hospital patients (3.9%). The 72 S. aureus isolates from nasal samples belonged to 16 different clonal complexes, particularly to CC 152-MSSA (22 clones) and CC1-MSSA (nine clones). Two clones were significantly associated with community settings: CC1-MSSA and CC45-MSSA. The MRSA strains belonged to the ST88-MRSA-IV or the CC8-MRSA-V complex. A very high prevalence of toxinogenic strains 52.2% (36/69), containing Panton-Valentine leucocidin- and EDIN-encoding genes, was identified among the S. aureus isolates in community and hospital settings. This study provides the first characterization of S. aureus clones and their genetic characteristics in Burkina Faso. Altogether, it highlights the low prevalence of antimicrobial resistance, high diversity of methicillin-sensitive S. aureus clones and high frequency of toxinogenic S. aureus strains.

IntroductionL’objectif de cette étude était de décrire les aspects épidémiologiques et diagnostiques de l’épidémie de choléra au Burkina Faso en 2005.MéthodesEtude rétrospective, d’août à octobre 2005. Elle a concerné dix districts sanitaires du Burkina Faso. A été inclus dans l’étude, tout patient présentant un syndrome cholériforme, admis dans les différentes formations sanitaires dont la coproculture s’est révélée positive à Vibrio cholerae.RésultatsAu cours cette épidémie, 1050 cas de diarrhées cholériformes ont été notifiés par l’ensemble des structures sanitaires du pays. Vibrio cholerae a été identifié à l’examen bactériologique des selles de 121 patients (17,2%), constituant notre population d’étude. Les hommes étaient majoritaires (57%). La moyenne d’âge était de 30 ans. Les femmes au foyer (24%) et les sujets non scolarisés (62,8%) représentaient les couches sociales les plus touchées. Les forages ont été la source de boisson de 39,7% des patients 72 heures avant le début de la maladie. Tous les patients ont présenté une diarrhée aqueuse. Vibrio cholerae, sérotype Ogawa, responsable de cette épidémie, était résistant au chloramphénicol et au cotrimoxazole dans respectivement 71,7% et 38,3% des cas. Ni le cas index, ni la source initiale de contamination n’ont pu être identifiés. La létalité de notre échantillon était de 3,5%.ConclusionCette épidémie a relancé la question de l’hygiène et mis à nu le problème de ces villes où la croissance démographique galopante est en inadéquation avec le degré d’urbanisation.

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