BackgroundEscherichia coli strains are commonly found in the gut microflora of warm-blooded animals. These strains can be assigned to one of the four main phylogenetic groups, A, B1, B2 and D, which can be divided into seven subgroups (A0, A1, B1, B22, B23, D1 and D2), according to the combination of the three genetic markers chuA, yjaA and DNA fragment TspE4.C2. Distinct studies have demonstrated that these phylo-groups differ in the presence of virulence factors, ecological niches and life-history. Therefore, the aim of this work was to analyze the distribution of these E. coli phylo-groups in 94 human strains, 13 chicken strains, 50 cow strains, 16 goat strains, 39 pig strains and 29 sheep strains and to verify the potential of this analysis to investigate the source of fecal contamination.ResultsThe results indicated that the distribution of phylogenetic groups, subgroups and genetic markers is non-random in the hosts analyzed. Strains from group B1 were present in all hosts analyzed but were more prevalent in cow, goat and sheep samples. Subgroup B23 was only found in human samples. The diversity and the similarity indexes have indicated a similarity between the E. coli population structure of human and pig samples and among cow, goat and sheep samples. Correspondence analysis using contingence tables of subgroups, groups and genetic markers frequencies allowed the visualization of the differences among animal samples and the identification of the animal source of an external validation set. The classifier tools Binary logistic regression and Partial least square -- discriminant analysis, using the genetic markers profile of the strains, differentiated the herbivorous from the omnivorous strains, with an average error rate of 17%.ConclusionsThis is the first work, as far as we are aware, that identifies the major source of fecal contamination of a pool of strains instead of a unique strain. We concluded that the analysis of the E. coli population structure can be useful as a supplementary bacterial source tracking tool.

OBJETIVO: Verificar a qualidade higiênico-sanitária da água de consumo humano em propriedades rurais por meio da contagem de indicadores microbiológicos de potabilidade. MÉTODOS: Foram colhidas 180 amostras de água utilizada para consumo humano das fontes, reservatórios e ponto de consumo em 30 propriedades rurais, situadas na região Nordeste do Estado de São Paulo. Determinou-se o número mais provável de coliformes totais, Escherichia coli e o número de microrganismos mesófilos. Foi verificada a presença de medidas de proteção das fontes de abastecimento. RESULTADOS: Os resultados evidenciaram que 90% das amostras de água das fontes, 90% dos reservatórios e 96,7% de água de consumo humano, colhidas no período de chuvas, e 83,3%, 96,7% e 90%, daquelas colhidas respectivamente nos mesmos locais, durante a estiagem, estavam fora dos padrões microbiológicos de potabilidade para água de consumo humano. CONCLUSÕES: A água utilizada nas propriedades rurais foi considerada um importante fator de risco à saúde dos seres humanos que a utilizam. A adoção de medidas preventivas, visando à preservação das fontes de água, e o tratamento das águas já comprometidas são as ferramentas necessárias para diminuir consideravelmente o risco de ocorrência de enfermidades de veiculação hídrica.

total de 150 carcaças de frango congeladas, de quatro marcas comerciais, foram analisadas para pesquisa de Salmonella. Foram examinadas 43 carcaças de cada uma das marcas A, B, D e 21 da marca C. Observou-se um percentual de 32,0% de contaminação. Foram identificados 11 sorotipos: S. Agona, S. Anatum, S. Enteritidis, S. Hadar, S. Havana, S. Mbandaka, S. Montevideo, S. Ouakam, S. Poona, S. Schwarzengrund e S. I 4, 5, 12: -. O antibiograma das cepas mostrou 100% de resistência à ampicilina, 75,0% à cefalotina, 52,1% à cefoxitina, 22,9% à tobramicina, 6,2% à polimixina B e à tetraciclina, 4,2% à gentamicina e 2,1% à netilmicina, ao aztreonam e à amicacina. Todas as cepas apresentaram sensibilidade total ao cloranfenicol e ao sulfazotrim.

RESUMO Utilizando

Pay-to-fish ponds are a common commercial activity in Brazil. Samples of water and Oreochromis niloticus were examined by PCR to detect the presence of pathogenic strains of Escherichia coli (O157, enteropathogenic and shiga toxigenic). Several pathogenic strains were detected in this study, providing useful epidemiological information for the proper management of these environments and animals in order to prevent faecal pollution, reducing health risks to the Brazilian population.