ANÁLISIS FILOGENÉTICO Y DISTRIBUCIÓN DE BEGOMOVIRUS EN EL CULTIVO DEL CHILE (Capsicum annuum L.) EN SINALOA, MÉXICO

Abstract

En el año 2017 el cultivo del chile (Capsicum annuum L.) en México registró una producción de 3 millones 54 mil toneladas. En los últimos cinco años se han registrado daños económicos y pérdidas de 20 % en la producción de chile a causa de Geminivirus. El objetivo del presente estudio fue determinar la distribución y variabilidad genética de los Begomovirus que infectan al chile en las principales zonas productoras de Sinaloa, México. Se colectaron 121 muestras de chile con síntomas de Begomovirus en los municipios de Escuinapa, Rosario, Concordia, Mazatlán, Elota, Culiacán, Guasave y Ahome. En las 121 muestras se detectaron Begomovirus mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR); el PHYVV se detectó en 74.4 % de las muestras, el PepGMV en 53.7 %, el TYLCV en 5.8 % y en 12.4 % no se identificó el tipo de Begomovirus; además, se detectaron infecciones mixtas entre los virus PHYVV, PepGMV y TYLCV con 5.8 % y en la combinación PHYVV y PepGMV con 36.4 %. Este es el primer reporte de una infección mixta bajo condiciones de campo en plantas de chile con un Begomovirus monopartita (TYLCV) y dos Begomovirus bipartitas (PHYVV y PepGMV) en los municipios de Rosario, Culiacán y Ahome del estado Sinaloa, México. Los virus PHYVV, PepGMV y TYLCV presentaron identidad nucleotídica del 94 al 99 % con lo reportado en GenBank. TYLCV se detectó en diferentes genotipos de chile; Serrano, Jalapeño, Morrón y Ancho en los municipios del Rosario, Culiacán y Ahome, lo cual indica una amplia distribución y rango de hospedantes de este Begomovirus en los diferentes genotipos de chile cultivados en Sinaloa.

Preliminary identification and phylogenetic relationships of begomoviruses associated with Capsicum spp. in the Yucatan peninsula, Mexico

“…), cucurbitáceas, okra (Abelmoschus esculentus), papaya (Carica papaya), tomate (Solanum lycopersicum) y maleza (ICTV, 2022). En un estudio anterior, de 119 plantas sintomáticas pertenecientes a 16 especies Advance online publication, 2022 accessions of C. chinense (Anaya-Lopez et al, 2003;Hernandez-Espinal et al, 2018;Hernandez-Verdugo et al, 2001).…”

“…Reportes previos han confirmado la incidencia de begomovirus en una variedad de plantas cultivadas de la familia Solanácea y flora nativa de varias regiones de México (Ascencio-Ibañez et al, 1999;Garrido-Ramirez y Gilbertson, 1998;Gregorio-Jorge et al, 2010;Hernández-Zepeda et al, 2007a;Hernández-Zepeda et al, 2007b;Hernández-Zepeda et al, 2007c;Torres-Herrera et al, 2019;Torres-Pacheco et al, 1996). En particular, el PepGMV ha sido reportado en chile cultivado y silvestre en diferentes regiones de México como Baja California, Sinaloa, Sonora, la Comarca Lagunera, Campeche, Yucatán, San Luis Potosí y Michoacán, entre otros lugares (Hernandez-Espinal et al, 2018;Morales-Aguilar et al, 2019;Rodelo-Urrego et al, 2015;Rodriguez-Negrete et al, 2019).…”

Caracterización molecular de un nuevo begomovirus aislado de cinco especies de arvenses colectadas en cultivos de tomate en Valle del Cauca

“…A la fecha hay reportadas 409 especies de virus pertenecientes a este género geminiviral, el cual se considera el más abundante que afecta plantas, superando ampliamente a los virus RNA pertenecientes al género Potyvirus (ICTV, 2018). Hoy por hoy son considerados una de las principales limitantes en la productividad agrícola que ocasiona reducción en la producción o pérdidas totales de las cosechas (Hernández-Espinal et al, 2018). Tal es el caso de los virus rizado amarillo de la hoja del tomate (tomato yellow leaf curl virus, TYLCV) y del mosaico de la yuca africana (African cassava mosaic virus, ACMV), quienes tienen un gran impacto en la agricultura por las cuantiosas pérdidas económicas generadas en cultivos de tomate y yuca, respectivamente (Scholthof et al, 2011); lo que ha despertado el ferviente interés científico para ser caracterizados a nivel molecular (Fondong, 2013) Gracias a mecanismos evolutivos como la recombinación o pseudo-recombinación los begomovirus han emergido e incrementado su diversidad, hecho que ha acentuado su importancia patogénica en las zonas tropicales y subtropicales del mundo particularmente en las familias botánicas Fabaceae, Euphorbiacea, Solanaceae y Malvaceae (Brown y Bird, 1992;Jones, 2003).…”

Primer reporte de begomovirus infectando cultivos de ají (<i>Capsicum</i> spp.) en Colombia

“…Los Begomovirus (Familia Geminiviridae) presentan un genoma de ADN cadena sencilla circular, son transmitidos por la mosca blanca (Bemisia tabaci) e infectan cultivos de interés económico exclusivamente pertenecientes a las dicotiledóneas (Brown et al, 2015). Los begomovirus pueden causar hasta el 20 % de pérdidas de la producción del cultivo de ají (Hernández-Espinal et al, 2018) y su alta incidencia en los últimos 30 años en las zonas tropicales y subtropicales del planeta los ha catapultado como uno de los principales grupos de virus emergentes, que limitan la producción de hortalizas. Su aparición está directamente correlacionada con el incremento en las poblaciones de su insecto vector, la mosca blanca (Roberts et al, 2004).…”