Identifikasi Cendawan Endofit Menggunakan Teknik Polymerase Chain Reaction

Legiastuti, Tuti Susanti; Aminingsih, Tri

doi:10.14692/jfi.8.2.31

Cited by 4 publications

(1 citation statement)

References 12 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Teknik tersebut diketahui memiliki kepekaan yang tinggi, cepat, dan akurat (Schoch et al, 2012) dibanding teknik morfometeri (Legiastuti & Aminingsih, 2012 (Prihatini, 2012). Di antara daerah cis-tron ribosom, ITS memiliki probabilitas tertinggi untuk identifikasi secara luas spesies cendawan, dengan pembeda yang relatif jelas pada variasi inter-dan intraspesifik (Schoch et al, 2012).…”

Section: Polymerase Chain Reaction (Pcr)unclassified

Identifikasi Tiga Isolat Cendawan Penghasil Gaharu Dari Nusa Tenggara Barat Dengan Menggunakan Primer Its Dan Tef 1-Α

Nugraheni

Anggadhania

Putranto

2015

JPTH

View full text Add to dashboard Cite

Several isolates of agarwood-forming fungus in Gyrinops versteegii have been isolated from the result of exploration in Lombok and Keywords : agarwood, Gyrinops versteegii, Fusarium solani ABSTRAKGaharu telah dikenal secara luas sebagai salah satu produk hasil hutan bukan kayu unggulan karena manfaat dan nilai ekonomisnya yang cukup tinggi. Beberapa isolat cendawan pembentuk gaharu pada jenis Gyrinops versteegii telah diisolasi dari hasil eksplorasi di pulau Lombok dan Sumbawa. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi tiga cendawan yang berasosiasi dengan pembentukan gaharu pada jenis Gyrinops versteegii asal Lombok Tengah, Alas, dan Lombok Barat, Nusa Tenggara Barat. Ketiga cendawan dibiakan dalam medium cair PDB (Potato Dextrose Broth) dan diinkubasikan selama 1 bulan sambil digojok. Miselium dari masing-masing cendawan dipanen untuk isolasi DNA. Amplifikasi dilakukan dengan Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan primer ITS dan TEF dan diperoleh amplikon yang memiliki panjang berkisar 300-600 pb. Hasil analisis BLAST menunjukkan bahwa ketiga cendawan memiliki kesamaan dengan Fusarium solani. Hasil tersebut dikonfirmasi dengan pohon filogenetik dimana ketiga cendawan uji mempunyai kekerabatan dengan F. solani.

show abstract

Section: Polymerase Chain Reaction (Pcr)unclassified

Identifikasi Tiga Isolat Cendawan Penghasil Gaharu Dari Nusa Tenggara Barat Dengan Menggunakan Primer Its Dan Tef 1-Α

Nugraheni

Anggadhania

Putranto

2015

JPTH

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Molecular characterization of indigenous microbes and its potential as a biological control agent of Fusarium stem rot disease (Fusarium verticillioides) on maize

Mirsam¹,

Suriani²,

Aqil³

et al. 2022

Heliyon

View full text Add to dashboard Cite

Isolation and Amplification DNA on Endophytic Fungi of Local Aromatic Rice Enrekang

Syamsia

Idham

Patappari

et al. 2019

IOP Conf. Ser.: Earth Environ. Sci.

View full text Add to dashboard Cite

Local rice is one of the biodiversity that is currently not explored in detail. The exploration of endophytic fungi of local rice in South Sulawesi was carried out to find out the types of endophytic fungi in the local rice plant. Plant samples were taken from local rice plantations in the Tator, Enrekang, and Luwu regencies. DNA isolation and PCR amplification were the initial stages that need to be carried out in molecular identification. DNA fungi extraction was performed by using DNesay DNA extraction KIT. The result of DNA fungi isolation was electrophoresed with 0.8% agarose gel in TAE buffer (Tris Acetate EDTA). DNA isolation was successfully carried out by the formation of DNA bands. DNA amplification of two endophytic fungi using the primary pairs of ITS1 and ITS4, with condition PCR of predenaturation at 95°C for 5 minute, denaturation at 94°C for 1 minute, annealing at 55,4°C for 1 minute, elongation at 72°C for 1 minute, final elongation at 72°C for 10 minute. The denaturation stage until the extension was repeated 35 times and produced DNA fragments with a molecular size of 700 bp and 600 bp.

show abstract

Identifikasi Cendawan Endofit Menggunakan Teknik Polymerase Chain Reaction

Cited by 4 publications

References 12 publications

Identifikasi Tiga Isolat Cendawan Penghasil Gaharu Dari Nusa Tenggara Barat Dengan Menggunakan Primer Its Dan Tef 1-Α

Identifikasi Tiga Isolat Cendawan Penghasil Gaharu Dari Nusa Tenggara Barat Dengan Menggunakan Primer Its Dan Tef 1-Α

Molecular characterization of indigenous microbes and its potential as a biological control agent of Fusarium stem rot disease (Fusarium verticillioides) on maize

Isolation and Amplification DNA on Endophytic Fungi of Local Aromatic Rice Enrekang

Contact Info

Product

Resources

About