Loqs depends on R2D2 to localize in D2 body-like granules and functions in RNAi pathways in silkworm cells

Knockdown of RNA interference pathway genes impacts the fitness of western corn rootworm

“…If this protein is involved in processing exogenous dsRNAs in WCR, reducing its expression may represent a possible path to eRNAi resistance for WCR. Reports in other insects suggest such a functionality in processing exogenous dsRNAs for LOQS 39 , 63 , though its role in the siRNA pathway is currently thought to predominate in the processing of endogenous siRNAs 64 , 65 . Characterization of LOQS as a core component of the D. melanogaster miRNA pathway has also been recently questioned; it has been reported as important late in pupation and ovary and ovariole formation, but some individuals survive the absence of this transcript and not all miRNAs require it for maturation 53 , 62 , 66 – 68 .…”

Μελέτη των μονοπατιών των μικρών μορίων RNA στο μεταξοσκώληκα (Bombyx mori)

“…Σε μία πρόσφατη μελέτη που αφορούσε σταθερά μετασχηματισμένα κύτταρα BmN4 του B. mori που εξέφραζαν τις πρωτεΐνες CeSID-1 και λουσιφεράση επιβεβαιώθηκε, έπειτα από εμβαπτισμό τους σε μέσο που περιείχε dsRNA, η συμμετοχή των γονιδίων BmDcr2 και BmAgo2 στην dsRNA-εξαρτώμενη αποσιώπηση, ενώ πιο ήπια αλλά υπαρκτή φαίνεται να είναι η συνεισφορά των BmR2D2 και BmLoqs (Zhu et al, 2015). Οι παρατηρούμενες διαφορές σε σχέση με τα αποτελέσματα αυτής της Διδακτορικής Διατριβής ενδεχομένως να σχετίζονται με τη μέθοδο που χρησιμοποιήθηκε για την εισαγωγή των dsRNAs στα κύτταρα, δηλαδή τον εμβαπτισμό αντί της διαμόλυνσης.…”

“…Ειδικότερα, η R2D2 είναι υπεύθυνη για τον εντοπισμό της Dcr2 στα σωμάτια D2, η οποία με τη σειρά της τη σταθεροποιεί, ενώ ακόμη είναι υπεύθυνη για τη σωστή ταξινόμηση των endo-siRNAs στην Ago2 και όχι στην Ago1 (Liang et al, 2015;Nishida et al, 2013). Κατ' επέκταση, στα κύτταρα μεταξοσκώληκα Bm5 και BmN4 ο κυτταροπλασματικός εντοπισμός των BmDcr2, BmR2D2 και BmAgo2 μπορεί να δικαιολογηθεί από τις ανάλογες λειτουργίες αυτών των πρωτεϊνών (Εικόνες 23-28) (Zhu et al, 2015). Στα πλαίσια του μονοπατιού siRNA, λοιπόν, αν και η BmR2D2 δεν εντοπίζεται σε κυτταροπλασματικά κοκκία τύπου D2, ωστόσο η έκφρασή της στο κυτταρόπλασμα είναι καθοριστική για το σχηματισμό τους, όπου συμμετέχουν οι πρωτεΐνες BmLoqs και BmDcr2 (Zhu et al, 2015).…”

“…Κατ' επέκταση, στα κύτταρα μεταξοσκώληκα Bm5 και BmN4 ο κυτταροπλασματικός εντοπισμός των BmDcr2, BmR2D2 και BmAgo2 μπορεί να δικαιολογηθεί από τις ανάλογες λειτουργίες αυτών των πρωτεϊνών (Εικόνες 23-28) (Zhu et al, 2015). Στα πλαίσια του μονοπατιού siRNA, λοιπόν, αν και η BmR2D2 δεν εντοπίζεται σε κυτταροπλασματικά κοκκία τύπου D2, ωστόσο η έκφρασή της στο κυτταρόπλασμα είναι καθοριστική για το σχηματισμό τους, όπου συμμετέχουν οι πρωτεΐνες BmLoqs και BmDcr2 (Zhu et al, 2015). Επιπλέον, ένας ακόμη λόγος για την BmAgo2 να εδράζεται στο κυτταρόπλασμα, πέραν της κυτταροπλασματικής της θέσης ως μέλος του συμπλόκου RISC, είναι και ο εντοπισμός της σε κυτταροπλασματικές μορφές διαφορετικού τύπου, όπως είναι τα κοκκία στρες (Zhu et al, 2013a).…”

“…Στα σωμάτια D2, οι πρωτεΐνες Dcr2 και R2D2 σχηματίζουν σύμπλοκο όσον αφορά στο μονοπάτι siRNA στο πλαίσιο μίας αμφίδρομης σχέσης, καθώς η Dcr2 σταθεροποιεί την R2D2, ενώ η R2D2 ρυθμίζει τον εντοπισμό της Dcr2 στα σωμάτια αυτά(Nishida et al, 2013). Σε σχέση με το μεταξοσκώληκα, σε κύτταρα BmN4 πρόσφατα βρέθηκε ότι η πρωτεΐνη BmDcr2 εντοπίζεται στα κυτταροπλασματικά κοκκία τύπου D2 (D2-body-like granules) και αλληλεπιδρά με τις BmR2D2 και BmAgo2, ενώ για την πρωτεΐνη BmR2D2 δείχθηκε ότι, αν και εδράζεται υπό διάχυτη μορφή στο κυτταρόπλασμα, είναι απαραίτητη για το σχηματισμό των κοκκίων τύπου D2 και, επιπλέον, αλληλεπιδρά με την πρωτεΐνη BmAgo2(Zhu et al, 2015). Myc και για τη BmR2D2 φορείς με τον επίτοπο Myc.His ή Flag.…”