SCREENING PENANDA MIKROSATELIT Shorea curtisii TERHADAP JENIS-JENIS SHOREA PENGHASIL TENGKAWANG

Abstract

ABSTRAKMetode seleksi primer merupakan metode yang efektif untuk mengembangkan penanda mikrosatelit dari jenis yang mempunyai kekerabatan dekat dalam suatu sistem taksonomi. Tujuan penelitian ini adalah mengembangkan penanda mikrosatelit pada jenis Shorea penghasil tengkawang yaitu Shorea gysbertiana, Shorea macrophylla, Shorea pinanga dan Shorea stenoptera menggunakan metode seleksi primer mikrosatelit dari Shorea curtisii. Contoh daun dari empat jenis Shorea dikumpulkan dari persemaian di Balai Besar Penelitian Bioteknologi dan Pemuliaan Tanaman hutan, Yogyakarta. Amplifikasi empat penanda mikrosatelit S. curtisii yaitu Shc-1, Shc-2, Shc-7 dan Shc-9 diuji pada empat jenis Shorea tersebut. Hasil menunjukkan bahwa sejumlah allele merupakan allele bersama antar jenis Shorea yang diuji. Nilai heterozigositas harapan (H E ) per lokus beragam, pada lokus Shc-1 berkisar antara 0,594 dan 0,722; lokus Shc-2 berkisar antara 0,219 dan 0,611;lokus Shc-7 berkisar antara 0,594 dan 0,779; lokus Shc-9 berkisar antara 0,594 dan 0,844. Koefisien inbreeding (F IS ) mempunyai nilai rendah dan tidak nyata menyimpang dari hukum keseimbangan Hardy-Weinberg pada hampir semua lokus kecuali lokus Shc-1 pada S. pinanga. Dendrogram membentuk dua kelompok: S. gysbertsiana dan S. macrophylla membentuk satu kelompok, sedangkan S. stenoptera dan S. pinanga membentuk satu kelompok yang lain. Penanda mikrosatelit yang telah dikembangkan dapat digunakan untuk studi genetik populasi dan sistem perkawinan pada jenis Shorea yang diuji.

Polymorphism of Simple Sequence Repeat Regions of Sulawesi Ebony (Diosphyros Celebica Bakh.) in Experimental Forest of Hasanuddin University Provenance

“…The result showed that only nine (53%) of 17 SSR primers from Diospyros could generate strong, clear and polymorphic bands at the 12 tested random samples of Ebony from Maros provenance. It revealed higher number of polymorphic primers compared to that of reported by Nurtjahjaningsih et al (2012). In their study, they used as many as 12 SSR primers from three pine species (Pinus densiflora, Pinus pinaster and Pinus taeda) to amplify Pinus merkusii DNA, but failed to produce polymorphic allele.…”

“…DNA markers from other species either in same genus or family are applicable to use to acquire molecular data. The closer taxonomic relation between evaluated individuals with selected markers, the higher success rate of markers to produce amplified DNA products (Nurtjahjaningsih et al, 2012). In this study, our objective was to obtain SSR primers of Ebony from selected SSR primers from the genus Diospyros using primer screening method.…”

HUBUNGAN KEKERABATAN Shorea gysbertsiana DENGAN TIGA JENIS SHOREA PENGHASIL TENGKAWANG LAINNYA BERDASARKAN PENANDA RAPD

“…Hasil analisis keragaman genetik beberapa jenis Shorea berdasarkan penanda SSR juga menampilkan angka yang lebih tinggi dari penelitian ini (Sulistyawati, Widyatmoko, & Nurtjahjaningsih, 2014;Widyatmoko, 2015 (Soerianegara & Lemmens, 1994). Berbeda dengan yang dilaporkan oleh Nurtjahjaningsih et al (2012), pada penelitian ini tidak ditemukan lokus bersama antara S. gysbertsiana dan S. pinanga. Hal ini menunjukkan bahwa hubungan kekerabatan antara S. gysbertsiana dan S. pinanga lebih jauh dibandingkan dengan 2 jenis Shorea lainnya (S. macrophylla dan S. stenoptera).…”

Induksi Mutasi Fisik dengan Iradiasi Sinar Gamma pada Kacang Merah

“…Tanaman yang mendapat perlakuan iradiasi sinar gamma 220 Gy berbeda sangat nyata lebih lama berbunga (± 6 hari) dari M0 (Tabel 2). Banyak faktor yang mempengaruhi pembungaan suatu tanaman baik internal maupun eksternal (Nurtjahjaningsih et al, 2012). Beberapa aksesi kacang merah diketahui memiliki perbedaan umur berbunga yaitu berkisar antara 30-35 HST (Rizqiani et al, 2007;Kristiani et al, 2014).…”