ABSTRAK Penelitian ini bertujuan menganalisis preferensi parameter oseanografi (SPL dan klorofil-a) terhadap hasil tangkapan ikan cakalang di perairan Pulau Misool dan Fakfak. Penelitian ini dilaksanakan pada Maret -Mei 2015 di Perairan Pulau Misool dan Fakfak, data berupa hasil tangkapan Maret -Mei 2015, SPL dan klorofil-a diperoleh dari citra satelit MODIS-Terra. Data dianalisis dengan menggunakan Softwere ArcGis 10.2, ENVI 5.1. dan softwere ORIGIN Versi 8.5.1. Hasil penelitian menunjukkan bahwa preferensi SPL dan konsentrasi klorofil-a terhadap ikan cakalang pada bulan Maret -Mei 2015 berada pada kisaran 29,50 -30,50°C dan konsentrasi klorofil-a sekitar 0,10 -0,20 mg/m 3 . ABSTRACT This study aims to analyze preference oceanographic parameters (SST and chlorophyll-a) of the Skipjack in the Misool dan Fakfak Waters. The research was conducted in March-May 2015 in the Misool dan Fakfak Waters, the data in the form of catch March to May 2015, SST and chlorophyll-a obtained from satellite imagery MODIS-Terra. Data were analyzed using Softwere ArcGis 10.2, ENVI 5.1. and softwere ORIGIN Versi 8.5.1. The results of the study showed that the preferences of the SPL and chlorophyll-a concentration of the Skipjack in the month of March to May, 2015 in the range of 29.50 to 30.50°C and chlorophyll-a concentration of about 0.10 to 0.20 mg/m 3 .