No abstract

This review summarizes relevant scientific literature analyzing the lung-gut axis and its association with coronavirus infection (COVID-19), lesions to the gastrointestinal tract caused by this infection, and state of the microbiome. Approximately 20%–50% of COVID-19 patients have such symptoms as nausea, vomiting, and diarrhea, as well as SARS-CoV-2 RNA detected in their feces. Therefore, investigation of the virus effect on the gastrointestinal tract and its commensal flora is important not only for research purposes, but for clinical practice, since patients with COVID-19 demonstrate both qualitative and quantitative changes in their microbiome. The latter may serve as a basis for the development of additional probiotic therapy for gastrointestinal lesions in COVID-19 patients. Despite the existing evidence, it is still necessary to clarify the effect of the intestinal microbiome on the pathogenesis of coronavirus infection and the disease course. Key words: COVID-19, coronavirus infection, microbiome, intestinal microbiota, SARS-CoV-2, probiotics, probiotic therapy

No abstract

Новая коронавирусная инфекция, вызванная тяжелым острым респираторным синдромом, коронавирусом 2 (SARS-CoV-2), возникла в Ухане, провинция Хубэй, в начале декабря 2019 года, далее быстро распространилась по всему Китаю, а затем и по всему миру, переросла в пандемию и продолжает угрожать здоровью людей. Во многих странах были зарегистрированы клинические случаи новой коронавирусной инфекции с проявлениями симптомов со стороны желудочно - кишечного тракта (такие симптомы, как потеря аппетита, тошнота, рвота, диарея, потеря вкуса, боли в животе) при отсутствии симптомов поражения со стороны дыхательных путей, а в фекалиях при этом идентифицирована РНК SARS-CoV-2. По данным разных авторов, частота болей в животе составляет 10-29 %, тошноты и рвоты - 10-29 %, диареи - от 30 до 50 % случаев. Симптомы могут быть связаны с непосредственным действием вируса на кишечный эпителий, ткань поджелудочной железы и связанной с этим ферментативной недостаточностью, развитием дисбиоза. В некоторых исследованиях были описаны многократные случаи обнаружения РНК SARS-CoV-2 в кале пациентов длительно с гастроинтестинальными проявлениями, одновременно у этих же пациентов ПЦР-мазки из зева и носа на SARS-CoV-2 при многократном заборе становились отрицательными, то есть возможна передача инфекции SARS-CoV-2 не только воздушно - капельным путем, но и фекально - оральным. В связи с чем анализ желудочно - кишечных симптомов (их частота и клинические особенности), предшествующих респираторным проявлениям во время COVID-19 или при отсутствии респираторных проявлений, может быть диагностически и эпидемиологически значим для улучшения раннего выявления и лечения новой коронавирусной инфекции. В данной статье представлен метаанализ желудочно - кишечных проявлений при COVID-19. В метаанализе рассматривается вопрос о степени вовлечения желудочно - кишечного тракта при SARS-CoV-2. Эти результаты могут помочь врачам - клиницистам своевременно установить и дифференцировать новую коронавирусную инфекцию. Клинические врачи могут недооценивать значимость проявлений желудочно - кишечных симптомов в практике, что может повлиять на точность постановки диагноза. Novel coronavirus infection causing a severe acute respiratory syndrome originated in Wuhan, Hubei province, at the beginning of December 2019. Clinical cases of novel coronavirus infection associated with gastro - intestinal symptoms (like loss of appetite, nausea, vomiting, diarrhea, loss of taste and abdominal pains), but without any symptoms of a respiratory disorder were registered in many countries. However, the fecal test showed RNA of coronavirus. The findings of different investigations show prevalence of abdominal pains being registered in 10-29 % cases, nausea and vomiting in 10-29 %, and diarrhea from 30 to 50 % cases. The symptoms can be due to direct action of the virus to the intestinal epithelial lining, pancreas tissue resulting in enzymatic insufficiency and development of dysbiosis. Some investigations note multiple cases of revealing RNA of coronavirus in fecal test of patients with prolonged gastrointestinal manifestations, at the same time the PCR swab tests from the nasopharynx, which were taken several times, showed negative results to coronavirus in these patients, i.e. coronavirus can be transmitted not only by air, but also by the fecal oral way. The analysis of gastro - intestinal symptoms (their prevalence and clinical peculiarities) followed by respiratory manifestations of COVID-19, or in a case of absence of respiratory symptoms, turn to be diagnostically and epidemiologically significant for early detection and treatment of novel coronavirus infection. Meta - analysis of gastrointestinal manifestations of novel coronavirus infection is presented in this article. The results may help the practitioners to diagnose and differentiate the novel coronavirus infection in due time.

Изменения состава микробиоты кишечника оказывают серьезное влияние на здоровье человека. Существует большой интерес к выявлению изменений состава микробиоты, характеристике и пониманию факторов, которые инициируют эти изменения. Обнаружено, что у детей частота гастроэнтерологических симптомов при этом заболевании, по данным разных авторов, составляет от 5 до 66 %. У взрослых диарея встречается с частотой 7,2-8,2 %, тошнота или рвота - 7,1-8,5 %, боль в животе - 2,0-3,4 %. Предполагается, что вирус SARS-CoV-2 повреждает кишечную стенку и повышает кишечную проницаемость, благодаря чему вирусные частицы попадают в кровь и вызывают тяжелое течение заболевания и изменение микробиоты. Это связывают с обнаружением вируса в кишечнике и нарушением состава кишечной микробиоты. В статье представлены результаты секвенирования 16S рРНК кала для оценки микробного разнообразия кишечника и ПЦР кала у детей при новой коронавирусной инфекции. Проведена оценка микробиома кала и ПЦР кала к SARS-CoV-2 у 35 детей от 3 до 14 лет с положительным ПЦР-мазком из зева и носа к SARS-CoV-2, из них 21 мальчик и 14 девочек. Забор кала для исследования проводился при установлении диагноза, через 2 недели после начала наблюдения и через 1 месяц. Changes in the composition of the gut microbiota have a major impact on human health. There is great interest in identifying changes in the composition of the microbiota, characterizing and understanding the factors that initiate these changes. It was found that in children the frequency of gastroenterological symptoms in this disease, according to different authors, ranges from 5 to 66 %. In adults, diarrhea occurs with a frequency of 7.2-8.2 %, nausea or vomiting 7.1-8.5 %, abdominal pain 2.0-3.4 %. The SARS-CoV-2 virus is thought to damage the intestinal wall and increase intestinal permeability, allowing viral particles to enter the bloodstream and cause severe disease and alteration of the microbiota. This is associated with the detection of the virus in the intestine and the disruption of the composition of the intestinal microbiota. The article presents the results of fecal 16S rRNA sequencing to assess intestinal microbial diversity and fecal PCR in children with a new coronavirus infection. The fecal microbiome and stool PCR for SARS-CoV-2 were assessed in 35 children from 3 to 14 years old with a PCR-confirmed throat swab of a new coronavirus infection, including 21 boys and 14 girls. Fecal sampling for the study was carried out at the time of diagnosis, 2 weeks after the start of observation, and 1 month later.